系统生物学

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基于图神经网络的中药系统生物学信息挖掘算法研究
《南京中医药大学学报》2025年第4期483-493,共11页张代峰 卞国强 何佳怡 谢佳东 胡晨骏 胡孔法 
国家自然科学基金面上项目(82074580);江苏省研究生科研创新计划项目(KYCX23_2079)。
目的构建中药-基因-蛋白复杂网络,优化中药潜在关联基因的挖掘方法,提升中药系统生物学信息的挖掘效能,为进一步探究中药作用机制提供帮助。方法提出融合注意力机制的图神经网络模型HERBGAT,以公开数据平台中少量的中药关联基因数据为输...
关键词:复杂网络 图神经网络模型 系统生物学 中药作用机制 
基于非编码RNA的针灸基础研究进展
《中国中医药信息杂志》2025年第3期174-179,共6页魏荧 熊坚 李萧 胡金群 赵燚 孙雨欣 凌发样 刘渝 杨丽源 梁繁荣 齐文川 
国家自然科学基金联合基金(U21A20404);国家自然科学基金面上项目(82074556);国家自然科学基金青年科学基金(82205286);中国博士后科学基金(2020M683642XB);四川省自然科学基金(2023NSFSC1819)。
针灸疗法是我国具有原创性优势的治疗保健方法。随着表观遗传学和系统生物学技术的迅速发展,非编码RNA(ncRNA)相关研究在针灸领域不断取得突破。本文整理ncRNA相关的针灸基础研究文献,对微小RNA(miRNA)、长链非编码RNA(lncRNA)和环状RNA...
关键词:非编码RNA 针灸 分子机制 表观遗传学 系统生物学 综述 
细胞生命过程数学刻画建模
《生物工程学报》2025年第3期1052-1078,共27页朱岩 孙际宾 
国家重点研发计划(2023YFA0913903);天津市合成生物技术创新能力提升行动(TSBICIP-CXRC-073,TSBICIP-PTJJ-012)
生物制造是使用工程细胞实现化学品、医药、能源、材料产品的规模化生产,也是应对全球环境危机,实现“双碳”目标,推动经济社会绿色转型的一种新兴生产力。高效设计并构建工程细胞需要精准、全面的数字细胞模型。测序仪、质谱、光谱、...
关键词:生物制造 细胞生命过程 数学模型 系统生物学 全细胞模型 
系统生物学在中医药现代化发展中的应用
《时珍国医国药》2025年第3期520-524,共5页纪茜茜 庄子涵 隆红艳 
国家自然科学基金面上项目(82174435);江苏省科技发展计划专题研究项目(ZT202210)。
系统生物学是对复杂的生物系统进行多重分析和建模的学科,运用系统生物学方法挖掘并简化中医药的复杂性,为中医药科学化、现代化发展提供新的视角和方法。通过总结中医药在理论与实践中的复杂性,概括目前系统生物学在中医药诊断、处方...
关键词:中医药现代化 系统生物学 复杂性科学 
中药四性的本草源流、药理学及系统生物学研究进展
《中药药理与临床》2025年第2期113-120,共8页郭晶晶 李硕 杨志军 杨秀娟 段国建 田一虹 魏江霞 李越峰 
国家自然科学基金资助项目(编号:82160755);甘肃省教育厅产业支撑计划项目(编号:2021CYZC-21);甘肃省教育厅项目(编号:2021B-157);甘肃省中医药管理局项目(编号:GZKP-2022-37);甘肃省青年科技基金项目(编号:20JR10RA331);西北中藏药协同创新中心开放基金(编号:Xbzzy-2022-08);甘肃省中药炮制技术传承基地建设揭榜挂帅项目(编号:2022-15)。
中药四性是传统中医药的基本理论之一,是历代医家在长期实践中经过反复验证得到的临床经验,对于指导临床用药具有重要的作用。近年来,从基础实验角度对中药四性的物质基础及作用机理进行了深入研究,因此通过古籍本草结合文献研究近况,...
关键词:中药四性 本草源流 动物实验 细胞实验 系统生物学 抑制 亢奋 紧密 疏松 免疫 代谢 
《生物化学与生物物理进展》征稿简则(2025年1月修订)
《生物化学与生物物理进展》2025年第1期258-264,共7页
1征稿范围与栏目设置1.1征稿范围本刊为国内外公开发行的全国性学术期刊(月刊)。征稿的学科范围是生物化学、分子生物学、生物物理学、细胞生物学、神经科学、免疫学,以及基因组学、蛋白质组学、系统生物学等相关学科领域。1.2栏目设置...
关键词:科教融合 生物物理学 会议简讯 学术期刊 系统生物学 栏目设置 神经科学 细胞生物学 
神经网络求解系统生物学中刚性问题的研究
《中山大学学报(自然科学版)(中英文)》2024年第6期265-274,共10页张艳玲 王梦收 洪柳 
国家重点研发计划(2023YFC2308702);广东省基础与应用基础研究基金(2023A1515010157)。
在系统生物学的研究中,由于所研究问题的复杂性和多尺度性,经常会遇到刚性方程的求解.而近年来,神经网络和深度学习的发展为上述问题提供了新的解决思路和方法 .本研究以经典的Belousov-Zhabotinsky(B-Z)反应和Van der Pol(VdP)方程为例...
关键词:系统生物学 刚性微分方程 神经网络 常微分神经网络 
系统生物学在前列腺癌中的应用进展
《中国男科学杂志》2024年第6期103-109,共7页周琳 朱晓雨 
南京市中医药青年人才培养计划(宁卫中医〔2020〕4号,ZYQ20005);江苏省研究生科研与实践创新计划项目(苏学位字函〔2023〕4号,SJCX23_0814)。
前列腺癌是男性常见的高发恶性肿瘤,异质性是其主要的病理特征,涉及多因素、多阶段的复杂过程。目前系统生物学已经广泛应用到前列腺癌的研究中,无论是新的肿瘤标志物或是新的治疗靶点都是时下热门,其在发病机制、早期诊断、鉴别诊断、...
关键词:系统生物学 前列腺肿瘤 个体化诊疗 
苗药复方泻停封胶囊治疗溃疡性结肠炎小鼠的活性及作用机制研究
《中医药通报》2024年第12期46-52,共7页张雪梅 钟渊涵 吴茜娃 冯艳 文丽云 彭昱 曾金祥 朱继孝 李星 蒋坤 冉娜 
贵州省科技计划项目(No.黔科合支撑〔2023〕一般101)。
目的:研究苗药复方泻停封胶囊(简称为“XTF”)治疗溃疡性结肠炎的活性及作用机制。方法:采用小鼠自由饮用葡聚糖硫酸钠诱导急性溃疡性结肠炎模型,并给予XTF进行干预,使用H-E染色法观察结肠组织病理学变化,运用试剂盒使用方法检测小鼠血...
关键词:泻停封胶囊 溃疡性结肠炎小鼠 系统生物学 生物信息学 作用机制 
微丝骨架结合蛋白在未成熟树突状细胞抗原吞噬过程中的差异表达分析
《医用生物力学》2024年第5期814-822,共9页李道红 罗代琴 曾宪琳 张帅 徐朴 吴翠芳 王赟 叶远浓 胡祖权 龙金华 曾柱 
国家自然科学基金项目(12132006,31771014,11762006,82060555)。
目的探讨未成熟树突状细胞(immature dendritic cells,imDCs)发挥抗原吞噬功能时关键微丝骨架结合蛋白(microfilament cytoskeleton-binding proteins,MCBPs)的差异表达情况。方法从健康人外周血中分离单核细胞(monocytes,MOs),经重组人...
关键词:未成熟树突状细胞 吞噬 微丝骨架 微丝骨架结合蛋白 系统生物学 
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