河南汉族人群6q24-25.1区域STR基因座的遗传多态性  被引量:1

Polymorphisms of STR loci hunted on 6q24-25.1 in Henan Han population

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作  者:张建勋[1] 乐晓萍[1] 杨洋[1] 朱运良[1] 

机构地区:[1]郑州大学基础医学院法医学教研室,郑州450001

出  处:《郑州大学学报(医学版)》2011年第4期566-568,共3页Journal of Zhengzhou University(Medical Sciences)

摘  要:目的:在6q24-25.1区域重新查找高密度的短串联重复序列(STR)基因座并分析其群体遗传学参数。方法:在河南汉族120例无关个体的6q24-25.1区域查找STR基因座,应用PCR和非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳及银染技术进行分型,调查其在河南汉族群体内的遗传多态性。结果:在6q24-25.1区域共11Mb范围内新查找到14个STR基因座(D6SZ1~14),平均间距为700kb,这14个STR基因座分别检出5、6、2、3、6、6、7、4、7、4、4、5、4和4个等位基因。其中D6SZ2、D6SZ6、D6SZ7、D6SZ8、D6SZ9和D6SZ12基因座的多态信息含量(PIC)分别为:0.65、0.57、0.62、0.60、0.61和0.64;个体识别率(DP)分别为0.857、0.811、0.821、0.803、0.829和0.827。结论:D6SZ2、D6SZ6、D6SZ7、D6SZ8、D6SZ9和D6SZ126个STR基因座是一组良好的遗传标记。新查到的14个微卫星基因座标记可有助于6q24-25.1区域复杂疾病基因的定位。Aim:To find new short tandem repeat(STR)loci of high density in 6q24-25.1 and to analyze their population genetic parameters.Methods:120 unrelated Han individuals in Henan province were selected as subjects of the study.The 14 STR loci in 6q24-25.1 were investigated by using PCR following polyacrylamide gel electrophoresis and silver staining technique for genetic polymorphism analysis.Results:14 STR loci(D6SZ1~14)had been found in 6q24-25.1,spanning 11 Mb,average interval of 700 kb.Among 120 unrelated individuals from Henan province,the number of alleles in 14 loci were 5,6,2,3,6,6,7,4,7,4,4,5,4,4,respectively.Polymorphic information content and discrimination power of D6SZ2,D6SZ6,D6SZ7,D6SZ8,D6SZ9 and D6SZ12 STR loci were 0.65,0.57,0.62,0.60,0.61,0.64,and 0.857,0.811,0.821,0.803,0.829,0.827.Conclusion:Six STR loci(D6SZ2,D6SZ6,D6SZ7,D6SZ8,D6SZ9 and D6SZ12)are satisfactory genetic markers.The 14 new STR loci could be used to localize the gene related to some disease.

关 键 词:短串联重复序列 杂合性缺失 6号染色体长臂 遗传多态性 

分 类 号:Q347[生物学—遗传学]

 

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