siRNA序列特征的RNA干扰效率预测的新方法  

Method for Prediction of RNA Interference Efficiency Based on Sirna Sequence Characteristics

作　　者：徐宝林[1] 于大川[2] 高冬[1] 张浩[1] 刘元宁[1] 

机构地区：[1]吉林大学计算机科学与技术学院,长春130012 [2]吉林大学第一医院疼痛科,长春130021

出　　处：《吉林大学学报（信息科学版）》2011年第5期436-443,共8页Journal of Jilin University（Information Science Edition）

基　　金：国家自然科学基金资助项目(60971089)

摘　　要：为了快速、准确预测siRNA(Small interfering Ribonucleic Acid)的干扰效率,通过对2 431条siRNA的统计学分析找到了一个可靠的预测新方法。通过统计学方法从众多特征中筛选出了19个与siRNA抑制效率相关的序列特征,并用这些特征给出了siRNA抑制效率水平的聚类方法,准确率达到81.1%。该方法将对高效的siRNA设计起到指导意义。To predict the siRNA （Small interfering Ribonucleic Acid） efficiency accurately, by the statistical analysis of 2 431 siRNA, we found a reliable new method of forecasting. We selected 19 sequence characteristics related to siRNA efficiency with statistical method and made out a clustering method for siRNA inhibiting efficiency level with these characteristics, the correct rate is up to 81.1%. This method provides orientation for high efficient siRNA design.

关 键 词：RNA干扰 干扰效率预测 序列特征 统计学分析 

分 类 号：TP399[自动化与计算机技术—计算机应用技术]