徐宝林

作品数：4被引量：6H指数：2
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供职机构：吉林大学计算机科学与技术学院更多>>
发文主题：SIRNA分子设计核糖核酸干扰基因沉默RNA干扰更多>>
发文领域：自动化与计算机技术更多>>
发文期刊：《吉林大学学报（信息科学版）》《吉林大学学报（工学版）》更多>>
所获基金：国家自然科学基金更多>>
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基于siRNA-mRNA结合热力学特征的高效siRNA筛选
《吉林大学学报（工学版）》2014年第1期191-195,共5页刘元宁 徐宝林 张浩 陈竟博 韩烨 禹剑龙 
国家自然科学基金项目(60971089);吉林大学'大学生创新创业训练计划'创新训练项目(2012B53146)
siRNA与靶标mRNA的相互作用的热力学特征对于其干扰效率至关重要。RNAup是维也纳RNA软件包提供的预测靶标区域的可接触性(accessibility)的软件,将其预测的热力学特征加入到siRNA序列特征里,用支持向量机筛选高效的siRNA,该模型能够很...
关键词：计算机应用 热力学 RNAI 支持向量机 干扰效率预测 
siRNA分子设计研究进展被引量：3
《吉林大学学报（信息科学版）》2012年第2期198-202,共5页孟庆霞 徐宝林 
为了设计高效的siRNA(Short-interfering Ribonucleic Acid)分子、最大限度地减少siRNA分子的脱靶效应(off-target effects),siRNA分子设计已经成为热门研究领域。siRNA分子设计主要是基于序列和能量特征,以及靶标的二级结构特征,基于...
关键词：小干扰核糖核酸分子设计 核糖核酸干扰 基因沉默 脱靶效应 
siRNA序列特征的RNA干扰效率预测的新方法被引量：3
《吉林大学学报（信息科学版）》2011年第5期436-443,共8页徐宝林 于大川 高冬 张浩 刘元宁 
国家自然科学基金资助项目(60971089)
为了快速、准确预测siRNA(Small interfering Ribonucleic Acid)的干扰效率,通过对2 431条siRNA的统计学分析找到了一个可靠的预测新方法。通过统计学方法从众多特征中筛选出了19个与siRNA抑制效率相关的序列特征,并用这些特征给出了si...
关键词：RNA干扰 干扰效率预测 序列特征 统计学分析 
基于动态算法的序列分析
《吉林大学学报（信息科学版）》2010年第1期41-46,共6页李誌 刘元宁 武泽旭 常亚萍 何飞 徐宝林 张浩 
国家自然科学基金资助项目(60673099;60873146;60971089)
为了获得2009年新型甲型H1N1流感病毒与2008流感病毒的基因序列及氨基酸序列的一致性,以便对一个基因家族的生物学特征有一个简明扼要的了解,针对目前流行的新型甲型H1N1流感病毒的基因序列及其所编码的氨基酸序列,采用动态规划算法对...
关键词：生物信息学 序列比对 相似性分析 
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