一种采用自适应免疫遗传算法的分子对接构象搜索方法  

作　　者：傅兵[1] 郭红[1] 

机构地区：[1]福州大学数学与计算机科学学院

出　　处：《信息系统工程》2011年第10期116-118,共3页

基　　金：福建省自然科学基金资助项目(2009J01283);福建省科技计划重点资助项目(2008H0026))

摘　　要：分子对接是计算机辅助药物分子优化设计中的重要组成部分。搜索算法和评分函数是当前分子对接研究的难点与热点。本文提出了一个基于自适应免疫遗传算法的分子对接构象搜索方法AutoDockAIGA。设计了基于自适应免疫遗传算法的构象搜索方法,运用此方法对蛋白质-配体复合物进行实验测试,实验结果与AutoDock3.05模拟退火算法和拉马克遗传算法在能量得分、对接精度和对接时间上进行对比分析,实验表明,AutoDockAIGA对接结果精确性高,收敛速度快,具有更高的寻优能力。

关 键 词：免疫遗传算法 分子对接 构象搜索 autodock3.05 

分 类 号：TP18[自动化与计算机技术—控制理论与控制工程]