基于知识库的基因组数据整合分析  

Knowledge-based sequence set enrichment analysis

作　　者：杨文涛[1] 石建涛[1] 陈明杰[1] 徐海峰[1] 王侃侃[1] 张济[1] 

机构地区：[1]上海交通大学医学院瑞金医院医学基因组学国家重点实验室,上海200025

出　　处：《生物信息学》2011年第4期318-321,共4页Chinese Journal of Bioinformatics

基　　金：国家自然科学基金重大项目(项目号:90919059)

摘　　要：数据整合逐渐成为生物数据分析的重要方向。随着高通量技术的广泛应用,基因组序列数据大量产生,而如何充分、高效地整合这些序列数据成为了一个难题。本文从序列角度出发设计了一套新的数据整合方法:序列群富集分析(SequenceSet Enrichment Analysis,SSEA),并用实验数据探讨了其潜在的应用价值,结果显示SSEA能更好的挖掘出序列数据中的复杂生物学信息。Data integration is becoming more and more important in biological data analysis.Due to significant advances in high throughput technologies,a large amount of DNA sequence data is available.However,there is still a lack of effective integration tools.We thus design an integration tool named Sequence Set Enrichment Analysis （SSEA）.Through the assessment of a published dataset,we demonstrate its utility to better understand complex information underlying sequence data.

关 键 词：数据整合 生物序列 生物信息学 SSEA 

分 类 号：Q51[生物学—生物化学]