狐、貉源犬瘟热病毒H和F基因的克隆与序列分析  

作　　者：闫如勋[1,2] 赵建军[1] 柴秀丽[1] 闫喜军[1,3] 倪佳[1] 张海玲[1] 高晗[1] 白雪[1] 张蕾[1] 陈立志[1] 吴威[1] 

机构地区：[1]中国农业科学院特产研究所,吉林吉林132109 [2]江苏科技大学生物与环境工程学院,江苏镇江212003 [3]吉林特研生物技术有限责任公司,吉林长春130122

出　　处：《江苏农业科学》2012年第1期23-26,共4页Jiangsu Agricultural Sciences

基　　金：国家农业科技成果转化资金(编号:2009GB2B100084)

摘　　要：为研究我国圈养狐、貉流行犬瘟热病毒(canine distemper virus,CDV)的基因分型与遗传变异情况,通过RT-PCR方法扩增与测序分析了2009年来源于山东省和河北省病料中的CDV H与F基因,并分别与GenBank CDV野毒株和疫苗株的基因序列比对,构建了核苷酸序列的系统发生树。H基因系统发生分析显示,6株毒株归属为Asia-1型。H蛋白氨基酸序列比较表明,除HeB(09)3株有8个潜在N-连接的糖基化位点外,其余毒株N-连接的糖基化位点均为9个。以往的研究结果显示,日本和中国台湾分离株的潜在N-连接糖基化位点为8～9个。6株野毒F蛋白编码区氨基酸的同源性为98.0%～99.5%,与CDV3(登录号EU726268)和Onderstepoort(登录号AF305419)疫苗株的同源性为89.1%～90.6%,F蛋白的前导区(1～135位氨基酸)与疫苗株相比的同源性为62.2%～66.7%;野毒株F蛋白氨基酸在108～110处比疫苗株CDV3多1个潜在N-连接的糖基化位点,HeB(09)3的F蛋白还在366～369位多1个潜在的N-连接的糖基化位点。目前在山东省和河北省2地狐狸和貉中流行的犬瘟热野毒株为Asia-1型,HeB(09)3株H蛋白和F蛋白在N-连接糖基化方面与其他5株野毒株有明显的不同。

关 键 词：狐狸 貉 犬瘟热病毒 血凝素蛋白基因 融合蛋白基因 遗传变异 

分 类 号：Q78[生物学—分子生物学]