基于pathway谱对药物重定位的探讨  

作　　者：叶浩[1,2] 杨琳琳[1,2] 曹志伟[3] 唐凯临[2] 李亦学[1,2] 

机构地区：[1]华东理工大学生物反应器工程国家重点实验室,上海200237 [2]上海生物信息技术研究中心,上海200235 [3]同济大学生命科学与技术学院,上海200092

出　　处：《科学通报》2012年第7期534-541,共8页Chinese Science Bulletin

基　　金：国家自然科学基金(30900832);肝肾疾病病证教育部重点实验室(上海中医药大学)开放课题;上海市教委"曙光计划"(07SG22);教育部"新世纪优秀人才计划"(NCET-08-0399);重大科技专项(2012ZX10005001)资助

摘　　要：新药开发一直面临着高投入低产出的困境.药物重定位(drug repositioning)是解决这一问题的有效方法,因而成为现今药物研究的热点之一.目前流行的方法主要是基于药物小分子的相似性或关联性(化学结构、副作用、表达谱和小分子-蛋白作用关系等),预测药物的新功能.由于仅仅依赖药物-药物之间的关系,这些新功能限制在现有药物的功能空间之内.本研究中提出一种以疾病为导向,基于pathway谱的药物-疾病关联性评估方法来预测药物的新功能.考虑到药物在临床应用中除了作用于预先设定的主要治疗靶点以外,还能作用于其他一些额外的靶点,而这往往是产生副作用或是新的治疗功能的原因.该方法充分利用药物的已有靶点信息,认为药物通过作用于多条疾病相关蛋白影响的pathway,达到调节疾病的病理过程的目的.以2010年全球最热销的8个药做测试,美国食品药品监督管理局(Food and Drug Administration,FDA)批准的主治功能排在前10的位置,超过60%的预测功能可以得到文献的直接支持.它可以作为以往方法的有效补充,为药物的重定位以及毒副作用评估提供一种新的视角.

关 键 词：药物重定位 pathway谱 药理功能 药物-疾病关系 

分 类 号：R9[医药卫生—药学]