盐藻新基因DsSTPK的克隆及生物信息学分析  

Cloning and Bioinformatics Analysis of a Novel Gene DsSTPK from Dunaliella salina

作　　者：薛飞[1] 柴晓杰[1] 余祝君[1] 张晓琳[1] 张婷[1] 

机构地区：[1]大连海洋大学海洋生物资源恢复与生境修复重点实验室,大连116023

出　　处：《中国生物化学与分子生物学报》2012年第3期289-295,共7页Chinese Journal of Biochemistry and Molecular Biology

基　　金：国家自然科学基金项目(No.30972240);辽宁省教育厅科学技术研究项目(No.2008T023)~~

摘　　要：采用RT-PCR和RACE技术克隆了杜氏盐藻DsSTPK的1种丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶基因(GenBank accession No.JN625213),命名为DsSTPK,并对其进行了生物信息学分析.结果表明,盐藻DsSTPK基因的cDNA全长为3 129 bp,可阅读框为2 184 bp,编码727个氨基酸.该蛋白为亲水性蛋白,无信号肽,无跨膜区域,为非跨膜蛋白,且定位于细胞质基质,二级结构的主要元件为无规卷曲和α螺旋,三维建模成功,在167～190位有1个蛋白激酶的ATP结合区、293～305位1个丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶活性区,存在多个潜在的磷酸化位点.进一步的进化分析表明,其与衣藻、团藻亲缘关系最近.这些研究结果为进一步阐明DsSTPK的功能及作用机制奠定了基础.

关 键 词：杜氏盐藻 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 全长CDNA 生物信息学分析 

分 类 号：Q78[生物学—分子生物学]