阿尔茨海默病相关基因的生物信息学分析  

Bioinformatic analysis of genes related to Alzheimer＇s disease

作　　者：李长征[1] 王慧[2] 吕蔚然[3] 周烨[4] 

机构地区：[1]南方医科大学南方医院中医内科, 广州510515 [2]南方医科大学南方医院门诊手术室,广州510515 [3]南方医科大学临床医学院, 广州510515 [4]南方医科大学基因工程研究所,广州510515

出　　处：《中华神经医学杂志》2012年第8期767-769,共3页Chinese Journal of Neuromedicine

基　　金：高等学校博士学科点专项科研基金（20114433120019）;广东省教育厅育苗工程项目（LYM11037）

摘　　要：目的通过生物信息学方法探讨阿尔茨海默病的发病相关基因，为阿尔茨海默病的基础研究和临床治疗提供新思路。方法从基因芯片公共数据库GEO中下载阿尔茨海默病相关基因芯片数据，利用String、KEGG、Panther等在线分析软件对差异表达基因进行生物信息学分析。结果在34个差异表达基因所编码的蛋白中，有25个蛋白与其他蛋白存在相互作用关系；相互作用过程中涉及多种生物学通路，与多个生物学过程和分子功能相关。结论阿尔茨海默病是多种基因相互作用的结果，其中与钙离子信号相关基因关系较为密切。Objective To investigate the genes associated with Alzheimer＇s disease （AD） by bioinformatics methods to provide new thoughts for basic research and clinical treatment of AD. Methods The microarray data of AD-related genes were downloaded from the Gene Expression Omnibus （GEO） database and analyzed by bioinformatics methods using String, KEGG and Panther databases. Results Of all the 34 differentially expressed genes, 25 were found to encode proteins with interactions; they referred to multiple biological pathways, biological processes and molecular functions. Conclusion The pathogenesis of AD involves multiple genes, especially genes with Ca^2＋ signaling, and investigations of these genes may provide valuable insights into the mechanism of AD.

关 键 词：阿尔茨海默病 基因芯片 生物信息学 

分 类 号：R749.16[医药卫生—神经病学与精神病学]