白芨属SRAP引物筛选及反应体系优化  被引量:3

Optimization of SRAP-PCR System and Primer Screening for Bletilla

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作  者:朱英[1,2] 刘永翔[1,2] 黄永会[1,2] 杨琳 刘作易[1,4] 

机构地区:[1]贵州省农业生物技术重点实验室,贵州贵阳550006 [2]贵州省生物技术研究所,贵州贵阳550006 [3]贵州省现代中药材研究所,贵州贵阳550006 [4]贵州省农业科学院,贵州贵阳550006

出  处:《贵州农业科学》2012年第11期1-3,7,共4页Guizhou Agricultural Sciences

基  金:国家科技支撑计划项目"淫羊藿;白及;金钗石斛;杠板归4种药材野生保护抚育关键技术研究及应用示范"(2009BAI74B02-2-03);贵州省科研机构创新能力建设专项"药用植物和作物资源研究与开发应用创新能力建设"[黔科合院所创能(2010)4002];贵州省农业科学院基金项目"黔产半夏ISSR遗传多样性研究"[黔农科合(基金)2011021]

摘  要:为给白芨种质遗传多样性评价、分子标记辅助育种和遗传改良研究提供基础,建立适于白芨SRAP-PCR扩增的反应体系,利用L16(45)正交试验设计对白芨SRAP-PCR反应体系中的各影响因子进行探索。结果表明:Mg2+浓度为影响白芨SRAP-PCR反应的关键因素;在优化的20μL SRAP-PCR反应体系中各组分的最适含量为10×Buffer 2.0μL,Mg2+2.5mmo1/L,dNTPs 0.5mmol/L,引物0.2μmol/L,Taq酶1.0U,模板DNA 2.0ng/μL。利用SRAP反应体系,从72对SRAP引物组合中筛选出条带清晰、扩增稳定、多态性好的引物15对。In order to provide basis for evaluation of genetic diversity,molecular marker assisted breeding,and genetic improving for Bletilla,the key factors in SRAP-PCR reaction system were studied based on the L16(45) orthogonal experimental design.The results showed that concentration of Mg2+ was the key factor.The optimized SRAP-PCR reaction system of Bletilla was obtained containing 2.5 mmol/L Mg2+,0.5 mmol/L dNTPs,0.2 μmol/L each primer,1.0 U Taq DNA polymerase and 2.0 ng/μL DNA template in total 20 μL.Then 15 primer pairs with stable amplification,clear banding patterns and good polymorphism were screened out from 72 SRAP primer pair combinations.

关 键 词:白芨 SRAP 体系优化 引物筛选 

分 类 号:S567.23[农业科学—中草药栽培]

 

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