我国重要人类病毒核酸和蛋白质序列微机数据库的建立和应用  

NUCLEOTIDE AND POLYPEPTIDE SEQUENCE DATABASE ESTABLISHED ON MICROCOMPUTERS FOR IMPORTANT HUMAN VIRUSES IN CHINA

作　　者：金冬雁[1] 金奇[1] 侯云德[1] 

机构地区：[1]病毒基因工程国家重点实验室

出　　处：《病毒学报》1991年第1期81-83,共3页Chinese Journal of Virology

摘　　要：利用微型计算机对病毒的核苷酸和多肽序列进行检索和分析,是分子病毒学研究的一项重要的新技术,而建立序列资料数据库是进行序列检索和分析的基础。目前国际上最大的两个核苷酸序列库GenBank(由美国政府支持)和EMBL(由欧洲分子生物学实验室支持),以及另一最大的NBRF(National Biomedical Resource Foundation)蛋白质序列库,都可提供供IBM微机使用的序列资料。但由于上述数据库系统需要囊括动物、植物和微生物的所有序列资料,难免不能及时反映重要人类病毒基因和蛋白质序列研究的最新进展。又因为上述几个序列库的序列资料均用二进制密码文件的方式存储,许多软件不能直接提取使用这些数据。因此,需要在吸取GenBank、EMBL和NBRF序列库资料的基础上,着手建立一套既及时反映分子病毒学最新进展,又便于同各种核酸和蛋白质序列分析软件联系的我国重要医学病毒的核苷酸和蛋白质序列库。A nudeotide and polypeptide sequence database for important human viruses in China was established on IBM-AT microcomputers by entering about 140 kb of nudeotide sequence data including those from hepatitis A virus,hepatitis B virus ( adr subtype), 6 virus ( HDV ), epidemic hemor-rhagic fever virus,human immunodeficiency virus, respiratory syncytial virus, human papilloma viruses, rotaviruses, rabies virus and vaccinia virus Tiantan, WR and Copenhagen strains. We also developed programs in BASIC or C language that help to extract sequence data from GenBank, EMBL and NBRF sequence databases and that of our own. The data can then be shared by various kinds of softwares for nudeotide and peptide sequence analysis.

关 键 词：人类病毒 核酸序列 蛋白质序列 

分 类 号：R373[医药卫生—病原生物学]