人类谷胱甘肽硫转移酶家族等位基因蛋白B与抑制剂作用模型的理论研究  

Theoretical Studies on Interaction Modes Between Human GSTP1 ＊B and Inhibitors

作　　者：徐钰[1] 崔颖璐[1] 郑清川[1] 张红星[1] 孙家锺[1] 

机构地区：[1]吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室,长春130021

出　　处：《高等学校化学学报》2013年第5期1226-1232,共7页Chemical Journal of Chinese Universities

基　　金：国家自然科学基金(批准号:20903045;21273095);高等学校博士点学科专项基金(批准号:20070183046)资助

摘　　要：采用分子动力学模拟方法系统地研究了谷胱甘肽硫转移酶家族(Glutathione S-transferases,GSTs)的等位基因蛋白B(GSTP1*B)与抑制剂利尿酸(EA)以及EA的谷胱甘肽(GSH)共轭物EAG(I),EAG(O)的具体结合方式.抑制剂及其谷胱甘肽共轭物与蛋白的相互作用能计算结果及分子动力学轨迹的统计分析结果表明,GSTP1*B与EA的谷胱甘肽共轭物的结合能力优于其与EA的结合能力,Phe8,Arg13,Trp38和Tyr108是作用过程中的关键残基,对稳定抑制剂及其谷胱甘肽共轭物在GSTP1*B的G和H位点的构象具有重要的作用.通过对构象的统计分析发现,残基Phe8和Tyr108与GSTP1*B酶对抑制剂的选择性密切相关.We constructed a high quality model of human GSTP1 ＊ B （ glutathione Stransferases, Pi class ＊ B variant） and revealed the interactions between protein and three inhibitors including ethacrynic acid （EA） and its conjugate of glutathione[ EAG（I） and EAG（O） ] to explore the structurefunction relationship via molecu lar dynamics（MD） simulations. Based on the results of interaction energy caculation and the analysis of MD simulation trojactory, several critical residues of stablizing the structure of G and Hsite, including Phe8, Argl3, Trp38 and Tyrl08, were identified. Our results also show that the conjutation of GSTP1 ＊ B protein may increase the binding ability of the inhibitor and the specific selectivity of Phe8 and Tyrl08 to the sub strate.

关 键 词：谷胱甘肽硫转移酶 分子动力学模拟 结合模式 利尿酸 抑制剂 

分 类 号：O641[理学—物理化学]