郑清川

作品数：30被引量：77H指数：5
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供职机构：吉林大学化学学院理论化学研究所更多>>
发文主题：分子动力学模拟分子对接同源模建分子动力学细胞色素P450更多>>
发文领域：理学医药卫生生物学农业科学更多>>
发文期刊：《特产研究》《物理化学学报》《分子科学学报》《吉林师范大学学报（自然科学版）》更多>>
所获基金：国家自然科学基金国家教育部博士点基金中央级公益性科研院所基本科研业务费专项国家科技支撑计划更多>>
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NaCCH自由基低能电子态的理论研究
《原子与分子物理学报》2018年第3期359-364,共6页张海丰 李颖 郑清川 李岚 韩海生 王东方 魏桂丹 
国家自然科学基金(21273095;51141009);佳木斯大学科学技术研究面上项目(Ljz2012-14;Lz2013-017;L2014-014);黑龙江省教育厅科研项目(2016-KYYWF-0569;12533069)
采用CASSCF/CASPT2方法研究了NaCCH自由基的低能电子态,在C2v对称性下给出了NaCCH自由基9个低能激发态的几何、组态、CI系数、振子强度、垂直激发能和绝热激发能.研究结果表明,NaCCH自由基的基态X1Σ+几何和转动系数与实验值是一致的;...
关键词：激发态 CASSCF/CASPT2方法 NaCCH自由基 自旋禁阻 
细胞色素P450蛋白酶对花生四烯酸羟基化和环氧化的理论研究
《吉林师范大学学报（自然科学版）》2016年第3期18-22,共5页郑清川 庄灿波 
国家自然科学基金项目(21273095)
花生四烯酸是人体内重要不饱和脂肪酸,它的代谢产物对人体具有重要的生理功能.细胞色素P450酶作为人体内重要的一种氧化还原酶,它能够代谢花生四烯酸产生羟基二十碳四烯酸(HETE)和表氧二十碳三烯酸(EET).通过量子化学中的密度泛函方法...
关键词：密度泛函 P450 花生四烯酸 羟基化 环氧化 
人类细胞色素P450 2E1酶在不同乙醇浓度下构象变化的分子动力学模拟（英文）被引量：2
《高等学校化学学报》2015年第11期2226-2235,共10页王衍 郑清川 
supported by the National Natural Science Foundation of China(No.21273095)~~
细胞色素P450(CYP)2E1家族酶是一种具有双重功能的单加氧酶,能够参与市场上6%药物的代谢而具有重要的作用.这类酶与酒精的消耗、糖尿病、肥胖症以及厌食症等密切相关,引起了广泛的研究兴趣.目前尚未见从原子水平上对这种酶在不同乙醇浓...
关键词：细胞色素P450 2E1酶 分子动力学模拟 结合自由能计算 
CYP2C9酶与Warfarin结合模型的立体选择性理论研究被引量：7
《高等学校化学学报》2014年第12期2605-2611,共7页吴云剑 崔颖璐 郑清川 张红星 
国家自然科学基金(批准号:21273095)资助~~
对CYP2C9酶与S-Warfarin复合物的晶体结构进行分子对接、分子动力学模拟、通道分析及结合自由能计算,发现原晶体结构中的结合模式为'亚稳态',提出了CYP2C9与S-Warfarin结合的可催化模式;比较了CYP2C9与S-和R-Warfarin结合的异同,确定了...
关键词：分子对接 分子动力学模拟 细胞色素P450 结合自由能分析 CYP2C9酶和S-Warfarin复合物 
细胞色素P450对底物的选择性及催化机制
《分子科学学报》2013年第6期461-468,共8页崔颖璐 郑清川 张红星 
国家自然科学基金资助项目(21273095)
细胞色素P450酶是广泛存在的含亚铁血红素单加氧酶,参与甾类激素的合成、脂溶性维生素代谢、多不饱和脂肪酸转换为生物活性分子,以及致癌作用和药物代谢.综述了细胞色素P450结构与功能的关系,特别是细胞色素P450对底物的选择性以及催化...
关键词：细胞色素P450 分子动力学模拟 底物选择性 
人类谷胱甘肽硫转移酶家族等位基因蛋白B与抑制剂作用模型的理论研究被引量：2
《高等学校化学学报》2013年第5期1226-1232,共7页徐钰 崔颖璐 郑清川 张红星 孙家锺 
国家自然科学基金(批准号:20903045;21273095);高等学校博士点学科专项基金(批准号:20070183046)资助
采用分子动力学模拟方法系统地研究了谷胱甘肽硫转移酶家族(Glutathione S-transferases,GSTs)的等位基因蛋白B(GSTP1*B)与抑制剂利尿酸(EA)以及EA的谷胱甘肽(GSH)共轭物EAG(I),EAG(O)的具体结合方式.抑制剂及其谷胱甘肽共轭物与蛋白的...
关键词：谷胱甘肽硫转移酶 分子动力学模拟 结合模式 利尿酸 抑制剂 
苯磺酰胺从碳酸酐酶Ⅱ中脱离过程的分子动力学模拟被引量：5
《物理化学学报》2013年第4期843-848,共6页孙维琦 张继龙 郑清川 孙志伟 张红星 
国家自然科学基金(21273095,20903045,21203072);高等学校博士点学科专项基金(20070183046);吉林大学基本科研业务费(201003044)资助项目~~
综合运用分子动力学模拟和自由能计算方法研究了苯磺酰胺分子从碳酸酐酶Ⅱ(CAⅡ)的活性位点脱离过程中底物与酶之间的动态相互作用.脱离过程的平均力势(PMF)显示,底物脱离时存在一个特殊的结合状态.其中,静电相互作用占据了主导地位.轨...
关键词：分子动力学模拟 自由能 苯磺酰胺 碳酸酐酶Ⅱ 底物结合 
(E)-2-(乙酰胺亚甲基)琥珀酸水解酶与其催化底物相互作用的理论研究
《黑龙江大学自然科学学报》2011年第5期655-659,675,共6页张红星 张继龙 郑清川 
国家自然科学基金资助项目(20903045)
通过分子对接和分子动力学模拟等理论方法研究(E)-2-(乙酰胺亚甲基)琥珀酸(E-2AMS)水解酶与其水解底物E-2AMS的结合方式。MM-PBSA结合自由能计算结果和动力学轨迹的统计分析都表明,在E-2AMS与水解酶形成的复合结构中,底物酰胺键采取反...
关键词：(E)-2-(乙酰胺亚甲基)琥珀酸 水解酶 分子对接 分子动力学模拟 MM-PBSA 
鹿茸多肽及其生长因子制备工艺的研究进展被引量：13
《特产研究》2011年第3期69-72,共4页张郑瑶 尚禹东 牟凤辉 陆成伟 郑清川 周秋丽 
吉林大学研究生创新基金资助项目(20111067)
鹿茸是我国传统中药材,鹿茸多肽及其生长因子具有重要的生理功能。本文综述了鹿茸多肽及其生长因子的提取、分离、纯化以及文库构建表达的应用前景。
关键词：鹿茸多肽 生长因子 文库构建 重组表达 
人类胞外信号调节激酶1的同源模建及其抑制剂的对接与结构改造被引量：2
《化学学报》2010年第3期222-226,共5页张继龙 侯瑞哲 李卓 郑清川 张红星 
国家自然科学基金(No20903045;20573042);国家科技支撑计划重点项目(No2006BAE03B01);高等学校博士点学科专项基金(No20070183046);吉林大学基本科研业务费(No200810018)资助项目
通过同源模建和分子动力学模拟构建了人类胞外信号调节激酶1(hERK1)的三维结构,并利用profile-3D和procheck方法评估了模型的合理性.对所得的结构使用分子对接程序Affinity和CDOCKER进行了两种抑制剂的对接.结果显示这两种抑制剂与酶的...
关键词：人类胞外信号调节激酶1 同源模建 分子动力学 对接 抑制剂 
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