病原菌特异基因数据库系统的开发及应用  

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作  者:陈晨[1] 杜鹏程[1] 吴一雷[2] 王海印[1] 张雯[1] 闫鹏程[2] 张媛媛[1] 陈禹保[2] 于伟文[1] 

机构地区:[1]中国疾病预防控制中心传染病预防控制所生物信息室传染病预防控制国家重点实验室,北京102206 [2]北京市计算中心

出  处:《中国预防医学杂志》2013年第5期396-400,共5页Chinese Preventive Medicine

基  金:国家自然科学基金项目(81201322);传染病预防控制国家重点实验室开放课题(2012SKLID310)

摘  要:利用前期研究获得的病原菌各分类水平特有同源基因,构建了病原菌特异基因数据库,采用四层架构模型和单向依赖结构构建了在线展示及查询系统,为科研工作者提供了病原菌特异基因基础数据。可通过简洁直观的方式进行查询和展示,为分型位点筛选、检测芯片设计、核心基因组研究等工作提供相应位点选择依据,为病原菌相关研究工作提供了便捷工具,可加快相关病原菌检测和分型方法的建立。在目前新型病原菌不断出现、治疗愈加困难等越来越严峻的传染病预防控制形势下,具有重要应用价值和现实意义。

关 键 词:病原菌 特异基因 数据库 

分 类 号:TP392[自动化与计算机技术—计算机应用技术] R378[自动化与计算机技术—计算机科学与技术]

 

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