基因识别问题及其算法实现  被引量:1

A New Method for Identifying DNA Sequences and Its Algorithm

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作  者:杨东[1] 张洋[2] 宋阳[3] 

机构地区:[1]中国科学技术大学化学系,合肥微尺度国家实验室,安徽合肥230026 [2]中国科学技术大学数学系,安徽合肥230026 [3]中国科学技术大学电子工程与信息科学系,安徽合肥230026

出  处:《数学的实践与认识》2013年第14期53-65,共13页Mathematics in Practice and Theory

摘  要:主要基于DNA序列的信噪比特征来进行基因识别.首先给出了Voss映射、Z-curve映射以及实数映射下对应的功率谱和信噪比三个公式,并用实例验证了碱基的3-周期现象与映射的选取无关.其次对于基因阈值的预测,提出了基于位置判定和基于距离平方的两种最优化方法,并对代表性生物的阈值判定结果作了分析比较.最后,提出了基于信噪比特征的基因识别算法,并预测了几种生物的基因编码区域.In this paper, gene identification is based on DNA sequences of SNR charac- teristics.Firstly, We define the SNRs and power spectrums of different mapping,verifying the relationless of mapping and 3-Base periodicity by real example.Secondly, two kinds of opti- mization methods based on the prediction of gene threshold value are presented and analyse the results of prediction.At last,the algorithm of identifying gene founded on the SNRS feature is proposed,which predict several biological gene coding region successfully

关 键 词:基因预测 阈值 信噪比 

分 类 号:TN911.4[电子电信—通信与信息系统] O242.1[电子电信—信息与通信工程]

 

参考文献:

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