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中国高粱株高和节间数全基因组关联分析及候选基因预测
《作物学报》2025年第3期568-585,I0677-I0687,共29页徐建霞 丁延庆 曹宁 程斌 高旭 李文贞 张立异 
贵州省基础研究计划(自然科学)项目(黔科合基础-[2024]青年077);贵州省科技计划项目(黔科合基础-ZK[2023]一般169,黔科合基础-ZK[2022]一般235);国家自然科学基金项目(32160459);贵州省育种科研基础平台创新能力建设项目(黔科合服企[2022]014);科研机构创新能力建设项目(黔科合服企[2022]007);贵州省农科院项目(黔农科种质资源[2023]06号)资助。
适当降低株高可以提高植物的养分利用效率和抗倒伏性,对高粱的高产和稳产具有重要意义。为揭示高粱株高遗传机制,本研究以242份中国高粱为研究对象,利用2,015,850个单核苷酸多态性(SNP)标记,在7个不同环境条件下对株高、节间数及节间长...
关键词：高粱 株高 节间数 全基因组关联分析(GWAS) 候选基因 
水稻中胚轴研究进展
《中国水稻科学》2025年第1期11-23,共13页任宁宁 孙永建 申聪聪 朱双兵 李慧菊 张志远 陈凯 
深圳市可持续发展专项(KCXFZ20211020164207012)。
水稻作为全球最重要的粮食作物之一,其生长发育特性对农业生产具有重要影响。水稻的中胚轴(Mesocotyl)是连接种子与幼苗的关键部分,在种子破土出苗过程中发挥着重要作用,其伸长性状在水稻直播栽培中尤为重要。中胚轴的伸长性能直接影响...
关键词：水稻 中胚轴 基因挖掘 候选基因预测 育种 
AI 大模型跨越物种边界,解码生命“密码全书”
《天天爱科学》2025年第2期6-9,共4页
斯坦福大学布莱恩·海伊(Brian L.Hie)团队在《科学》杂志上发表了一项开创性研究成果--Evo,-个能够解码和设计DNA、RNA和蛋白质序列的大规模基因组基础AI模型。根据研究团队描述,Evo模型在进行了3000亿次DNA训练后,能够在特定情况下进...
关键词：《科学》杂志 基因预测 布莱恩 斯坦福大学 实验检验 AI 蛋白质序列 研究团队 
玉米南方锈病抗性相关遗传区段定位与候选基因预测
《玉米科学》2025年第2期28-37,共10页聂蕾 何玥 郭爽 王栋 涂亮 刘鹏飞 李娟 王安贵 蒋喻林 祝云芳 陈泽辉 吴迅 郭向阳 
贵州省科技支撑计划项目(黔科合支撑〔2022〕重点029);贵州省育种科研基础平台创新能力建设项目(黔科合服企〔2022〕014);贵州省科技计划项目(黔科合基础-ZK〔2023〕一般173);贵州省自然科学基金项目(黔科合基础〔2022〕一般236);黔农科院国基后补助项目〔2022〕02号和〔2022〕09号;贵州喀斯特山区重要作物生物育种平台建设项目(黔科合中引地〔2023〕033);贵州省育种科研基础平台创新能力建设项目(黔科合服企〔2022〕014);科研机构创新能力建设项目〔(2022〕007)。
以抗、感自交系QB7866和QB5725为亲本构建的132份F2:3家系和包含142份温热玉米自交系组成的关联群体为材料,利用简化基因组测序技术和包含6万个SNP标记的MaizeSNP50芯片,分别对F2:3家系和关联群体进行基因型鉴定,对这两套群体的南方锈...
关键词：玉米 南方锈病 连锁分析 关联分析 候选基因 
岩溶湖泊微生物群落结构及功能基因预测
《安全与环境学报》2025年第2期767-778,共12页梁丽营 杨景媛 牟春霞 杜军 欧宇翔 李炫漫 刘细祥 刘艳 
国家自然科学基金地区项目(41967030);2021年引进人才科研启动项目(2021KJQD30);2022年引进人才科研启动项目(2022KJQD34);广西水工程材料与结构重点实验室资助课题(GXHRI-WEMS-2022-10);广西高校中青年教师科研基础能力提升项目(2021KY0169,2024KY0182)。
为揭示岩溶泉上覆水的水化学特征,总结分析微生物多样性、群落组成特征及潜在功能基因预测结果,挖掘微生物与环境因子的相互作用关系,采集灵水岩溶泉的上覆水,并采用地球水化学法、16S rRNA基因的高通量测序法测定分析样品中的水化学特...
关键词：环境工程学 岩溶泉水 微生物多样性 群落结构 16S rRNA高通量测序 功能基因 
定向纳米孔病原学测序技术在器官移植感染防治中应用的多中心专家共识
《中国普外基础与临床杂志》2025年第1期15-21,共7页黄一鸣 孙云柯 王普森 赵东 阙伟涛 方泰石 陈琦军 杨亮 夏雨 高伟 郭文治 傅志仁 栗光明 孔凌祥 汪守平 蔡金贞 吕国悦 吴忠均 陈刚 杨家印 钟林 
国家重点研发计划项目(项目编号:2022YFC2304705);“癌症、心脑血管、呼吸和代谢性疾病防治研究”重大专项(2023ZD0502400);四川省科技厅重点研发项目(项目编号:2024YFFK0312);国家自然科学基金面上项目(项目编号:82070674、82270691)。
器官移植是终末期器官疾病的重要治疗手段,移植术后感染显著影响患者预后。传统感染检测及诊断因灵敏度、特异性和检测速度的不足难以满足精准预防和控制感染的需求。定向纳米孔病原学测序技术(简称“纳米孔测序技术”)凭借读长优势、...
关键词：器官移植 定向纳米孔病原学测序 三代测序 术后感染 耐药基因预测 
一个小麦芒长基因的初步定位及候选基因预测
《浙江农业学报》2025年第1期14-23,共10页杨晓雨 马指挥 魏青 牛志鹏 陈安琪 胡正冲 王林生 
河南省农业良种联合攻关项目(2022010104);河南省科技攻关项目(182102110207)。
小麦芒作为影响产量和抗逆性的重要农艺性状引起了许多小麦遗传改良工作者的广泛关注。本文以藁优2018(全芒)与科大102(顶芒)及其构建的F2分离群体为试验材料,在小麦抽穗期对其主要农艺性状进行统计分析,并利用SSR分子标记对小麦芒长基...
关键词：普通小麦 芒长 遗传分析 候选基因 
基于前列腺癌骨转移BMP相关差异表达基因预测前列腺癌患者的转移复发
《江苏大学学报（医学版）》2024年第6期522-531,541,共11页邱蘜 胡建鹏 
江苏省卫生健康委科研项目(M2021038)。
目的:基于生物信息学方法构建预测前列腺癌(PCa)骨转移的预后风险模型,探究风险评分对预后和免疫浸润的影响。方法:从基因表达公共数据库(GEO)下载PCa患者的临床资料和微阵列表达数据,分子特征数据库(MSigDB)下载骨形成蛋白(BMP)通路相...
关键词：前列腺癌 骨转移 BMP信号通路 预后风险模型 免疫浸润 
基于16S rDNA测序分析毛滴虫对猕猴肠道菌群结构的影响
《中国畜牧兽医》2024年第11期4974-4983,共10页李鹤龄 陈智岗 宗发梁 宁卿 严玉霖 王宏 
国家自然科学基金(31960121);云南省自然科学基金项目(202001BC070001、202102AA100053)。
【目的】通过16S rDNA测序技术分析毛滴虫感染对猕猴肠道菌群结构的影响,为临床研究利用微生物替代抗生素治疗毛滴虫病提供参考依据。【方法】分别收集毛滴虫阳性和阴性的猕猴新鲜粪便样本各6份,通过宏基因组测序进行肠道菌群和功能基...
关键词：猕猴 毛滴虫 16S rDNA 肠道菌群 功能基因预测 
玉米抗莠去津相关性状的全基因组关联分析及候选基因预测
《山东农业科学》2024年第11期28-35,共8页肖平方 肖逸飞 吴舟 黄一 陈宝 涂亮 刘鹏飞 蒋喻林 郭向阳 王安贵 祝云芳 陈泽辉 吴迅 
国家重点研发计划项目(2023YFD1201103);贵州省科技支撑计划项目(黔科合支撑〔2022〕重点029);贵州省山地农业关键核心技术攻关项目(GZNYGJHX-2023012);贵州省育种科研基础平台创新能力建设项目(黔科合服企〔2022〕014);黔农科院国基后补助(〔2021〕16号,〔2022〕02号,〔2022〕09号);贵州喀斯特山区重要作物生物育种平台建设项目(黔科合中引地〔2023〕033);贵州省科研机构创新能力建设专项(〔2022〕007)。
为挖掘玉米抗除草剂相关候选基因,本研究以包含234份玉米自交系的关联群体为材料,结合包含56000个SNPs标记的基因型鉴定结果和该群体抗莠去津相关性状的评价数据进行全基因组关联分析。结果显示,全基因组关联分析共鉴定出62个与玉米抗...
关键词：玉米 莠去津 全基因组关联分析 候选基因 分子标记 
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