全基因组关联分析

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基于GWAS Catalog数据库样本分析39种血浆凝血因子与慢性肾脏病的关系
《中国组织工程研究》2025年第24期5272-5280,共9页彭泽鸿 朱曦 文江龙 朱文卓 刘超 唐鉴为 曹子玥 朱俐俐 
湖南省教育厅科学研究项目(21C0056),项目负责人:朱俐俐;湖南省教育厅科学研究项目(20C1152),项目负责人:刘超;湖南省教育厅研究生科研创新项目(CX20230530),项目负责人:彭泽鸿。
背景:在许多观察性研究中表明,血浆凝血因子与慢性肾脏病密切相关。尽管如此,血浆凝血因子与慢性肾脏病之间的因果关系仍尚未完全揭示清楚。目的:采用双样本孟德尔随机化方法评估和探讨血浆凝血因子与慢性肾脏病风险之间的关联。方法:从...
关键词:血浆凝血因子 慢性肾脏病 孟德尔随机化 因果关系 遗传变异 遗传流行病学 工具变量 单核苷酸多态性 全基因组关联分析 敏感性分析 
椎间盘退行性变与473种肠道菌群的关系:芬兰数据库大数据信息可借鉴的意义
《中国组织工程研究》2025年第20期4369-4378,共10页王梓焜 李树栋 高泷 范书豪 李城 孟纯阳 
国家自然科学基金面上项目(82372477),项目负责人:孟纯阳;山东省自然科学基金重点项目(ZR2020KH010),项目负责人:孟纯阳。
背景:有研究表明,调节肠道菌群可能会影响椎间盘退变的进程。然而,肠道菌群与椎间盘退变的因果关系尚不清楚。目的:采用孟德尔随机化方法来评估肠道菌群与椎间盘退变之间的潜在因果关系。方法:应用公开发表最新的473种肠道菌群的全基因...
关键词:孟德尔随机化 椎间盘退变 肠道菌群 全基因组关联分析 单核苷酸多态性 逆方差加权法 水平多效性 敏感性分析 
免疫细胞介导不同脂质与膝骨关节炎的相关性:欧洲个体全基因组关联分析
《中国组织工程研究》2025年第18期3934-3940,共7页霍将 丁宇 原杰 
山西省基础研究计划自由探索类青年研究项目(202203021212053),项目负责人:霍将;山西省基础研究计划自由探索类青年研究项目(20210302124670),项目负责人:原杰;山西省高等教育“百亿工程”科技引导专项(BYJL031),项目参与人:原杰。
背景:观察性研究发现脂质与免疫细胞对于骨关节炎进展具有双重影响,但其具体作用机制尚不清楚。目的:探究脂质与膝骨关节炎的因果关系是否受免疫细胞调控。方法:179种脂质来源于Linda Ottensman数据库,从Open GWAS上获取到了731种免疫...
关键词:脂质 膝骨关节炎 孟德尔随机化 免疫细胞 中介分析 因果关系 工程化组织构建 
肠道菌群与骨质疏松症的遗传关系:来自英国数据库211个肠道微生物群分析
《中国组织工程研究》2025年第18期3941-3947,共7页方志杰 马抢平 董万涛 吴俊媛 陆韵霖 
国家自然科学基金项目(81960878),项目负责人:董万涛;甘肃省科技计划项目-重点研发计划(21YF5FA017),项目负责人:董万涛;兰州市城关区科技人才创新创业项目(2023-rc-7),项目负责人:董万涛;兰州市科技计划项目(2023-2-83),项目负责人:董万涛。
背景:骨质疏松症被定义为一种慢性代谢性骨病,大量的证据表明肠道菌群与骨质疏松症有关。然而,肠道菌群对骨质疏松症的因果关系尚不清楚。目的:采用双样本孟德尔随机化方法来评估肠道菌群与骨质疏松症之间的潜在因果关系。方法:使用MiBi...
关键词:孟德尔随机化 骨质疏松症 肠道菌群 单核苷酸多态性 因果关系 全基因组关联分析 逆方差加权法 敏感性分析 
棉花60K功能位点基因芯片的制备及应用
《作物学报》2025年第5期1178-1188,共11页王亚雯 戚正阳 尤佳琦 聂新辉 曹娟 杨细燕 涂礼莉 张献龙 王茂军 
湖北省支持种业高质量发展专项课题项目(HBZY2023B002-5);农业生物育种国家科技重大专项(2023ZD0403801,2023ZD0403901)资助。
棉花是最重要的天然纺织纤维来源,同时是重要的油料来源。功能位点基因芯片作为一种可以提高育种值评估准确性和育种效率的工具,在棉花中应用较少。本研究制备了一款棉花60K功能位点基因芯片。该芯片制备基于已获得的棉花不同品种的Assa...
关键词:棉花育种 基因芯片 棉花60K功能位点基因芯片 全基因组关联分析 驯化选择 
全基因组关联分析在猪育种中的应用
《浙江畜牧兽医》2025年第2期12-13,共2页宋雪莹 
选择育种是一种重要的遗传改良方法,通过对群体进行选择和淘汰,以达到改良性状并获得更加高产、优质或抗逆的稳定遗传的新品种。这种方法在育种过程中,通过精心选择和杂交,可以筛选出具有优良性状和适应性强的个体,为品种改良和优化打...
关键词:遗传改良 选择育种 猪育种 优良性状 
调控超甜玉米种子贮藏物质利用率GWAS分析及候选基因挖掘
《玉米科学》2025年第4期34-41,共8页余育林 刘杰 王东兴 孙涛 崔妮妮 陈磊 程昕昕 余海兵 
安徽省高校自然科学研究重大项目(KJ2019ZD57);安徽科技学院科研发展基金项目(FZ230126)。
利用玉米56K基因芯片获得的SNP标记,采用MLM(Q+K)模型,对种子贮藏物质利用率进行全基因组关联分析(GWAS)及候选基因挖掘,揭示超甜玉米种子贮藏物质利用率的遗传特性。结果表明,共定位到6个调控种子贮藏物质利用率显著关联的SNP位点,贡...
关键词:超甜玉米 种子贮藏物质利用率 全基因组关联分析 候选基因 
杜洛克猪×二花脸猪F2代杂交猪免疫性状全基因组关联分析
《中国畜牧兽医》2025年第4期1455-1467,共13页苗娜 乔嘉坤 杨慧 韩萍萍 许方军 车兆轩 代翔毓 徐明航 龙志伟 朱猛进 
国家自然科学基金(31961143020);国家重点研发计划(2021YFD1301201);国家生猪产业技术体系项目(CARS-35)。
【目的】猪是重要的农业动物,其免疫性状的解析对于提高生产效率和抗病能力至关重要。本研究旨在鉴别与杜洛克猪×二花脸猪F2代杂交猪免疫性状相关的候选基因,为猪抗病育种提供重要的候选基因信息。【方法】采集294头杜洛克猪×二花脸...
关键词: 细胞因子 免疫性状 全基因组关联分析 候选基因 
玉米苗期低温抗性全基因组关联分析
《玉米科学》2025年第4期49-55,共7页于滔 张建国 曹靖生 李树军 蔡泉 马雪娜 殷跃 李昕 李思楠 李云龙 孙岩 
黑龙江省科研业务费项目(CZKYF2025-1-B002);黑龙江省农业科学院创新工程资助项目(CX23ZD05,CX23JQ04);黑龙江省种业创新发展项目(2024HZYCXNK07);国家玉米产业技术体系项目(CARS-02-07);科技创新2030-重大项目(2023ZD0402804-2)。
低温冷害严重制约北方春玉米区玉米的产量和品质。为了丰富寒地玉米响应低温胁迫的遗传理论基础,选用296份国内外优良玉米自交系为材料,在苗期进行5℃低温胁迫,结合24 042个高质量的SNP标记对玉米苗期低温抗性进行全基因组关联分析。结...
关键词:玉米 低温 苗期 全基因组关联分析 
德州驴体尺性状的全基因组关联分析
《畜牧兽医学报》2025年第4期1744-1754,共11页李聪 苏江天 李一丹 王朝飞 于杰 雷初朝 党瑞华 
第三次全国畜禽遗传资源普查项目(K4050422227);陕西省秦创原科学家+工程师项目(2022KXJ-112);中央引导地方项目(K3030922098)。
旨在探究德州驴体尺性状的遗传基础,本研究采集2~3周岁的健康德州驴母驴血液作为试验材料,共139头。测定试验群体的体尺性状,并进行描述性统计分析。利用“家驴一号”40K液相芯片对全部个体进行基因分型。使用混合线性模型对11个体尺性...
关键词:德州驴 体尺性状 全基因组关联分析 精细映射 
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