鹅掌楸Genomic-SSR反应体系优化  被引量:6

Optimization of Genomic-SSR Reaction System in Liriodendron

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作  者:贾波[1] 徐海滨[2] 徐阳[1] 龙晓飞[1] 陈金慧[1] 施季森[1] 

机构地区:[1]南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室,江苏南京210037 [2]中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所濒危药材繁育国家工程实验室,北京100193

出  处:《林业科学研究》2013年第4期506-510,共5页Forest Research

基  金:国家高技术研究发展计划(863计划)资助(课题编号:2013AA102705);国家自然基金(31170619)

摘  要:鹅掌楸属(Liriodendron L),是木兰科(Magnoliaceae)植物,属古老属种之一。由于第三纪晚期气候剧变和更新世冰川作用,到目前为止仅剩中国马褂木(L.chinense(Hemsl.)Sarg.)和北美鹅掌楸(L.tulipifera L.)两个残遗种[1]。鹅掌楸属植物在植物系统学中有特殊地位,以及具有原始的花结构等,这使得它们成为研究植物进化、开花植物历史进程、群体结构以及交配系统等的理想材料[2-4]。此外,鹅掌楸植物具有重要的经济价值和生态价值[5]。除为生产提供优质木材外,还具较强抗性[6-7],内含丰富的医用化合物[8-9]以及生物质燃料的生[10-12]The optimization of the Genomic-SSR reaction system is a basic protocol when the Genomic-SSR is used for genetic analysis in Liriodendron.The concentrations of Mg 2 +,dNTP,Primer and rTaq were tested by L 9(3 4) orthogonal experiment and single factor gradient experiment to gain the optimal reaction system.The results indicated that the optimal reaction system should contain 75 ng of genomic DNA,1 μL of 10 × buffer,0.4 μL of 10 mmol.L-1 dNTP,0.75 μL of 2.5 mmol.L-1 MgCl 2,0.25μL of 10 μmol.L-1 Primer,0.05 μL of 5 U rTaq and final volume of 10μL.Repeated trials and two verification tests showed that this optimal reaction system was stable,reliable,efficient and suitable for the applications of Genomic-SSR in Liriodendron population genetics and quantitative genetics research.

关 键 词:GENOMIC-SSR 鹅掌楸 正交试验 单因素梯度试验 

分 类 号:S718.46[农业科学—林学]

 

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