GENOMIC-SSR

作品数：18被引量：152H指数：7
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桤木Genomic-SSR与EST-SSR分子标记的差异分析
《四川林业科技》2023年第4期36-42,共7页王泽亮 杨勇智 杜晋城 陈炙 黄振 郭洪英 
世界银行贷款长江流域上游森林生态系统恢复项目(2019-510000-02-01-400761);四川省科技计划项目(2021YFYZ0032)。
桤木(Alnus cremastogyne)为非豆科固氮树种,也是我国最重要的一个桤木属特有种,具有重要的生态功能。本文分析了桤木基因组SSR与EST-SSR两种来源标记的遗传差异,结果显示EST-SSR的平均等位基因数与平均有效等位基因数高于Genomic-SSR,...
关键词：桤木 简单序列重复 遗传多样性 多倍体 GenoDive 
Genetic diversity in eggplant(Solanum melongena L.)germplasm from three secondary geographical origins of diversity using SSR markers被引量：1
《BIOCELL》2021年第5期1393-1401,共9页DEBI RANI DATTA MOHD RAFII YUSOP AZIZAH MISRAN MASHITAH JUSOH YUSUFF OLADOSU FATAI AROLU AZADUL HAQUE NADZIRAH MSULAIMAN 
the Malaysia Ministry of Education’s for the Long-Term Research Grant Scheme(LRGS)on Sustainable vegetable production technology for food security in urban agriculture(LRGS/1/2019/UKM/01/5/4).
Indo-Burmese region was the primary center of eggplant diversity from where the crop extended to several secondary origins of diversity.In this study,the genetic diversity among fifty-six eggplant accessions collected...
关键词：Solanum melongena Molecular diversity GENOMIC-SSR EST-SSR 
刺槐Genomic-SSR与EST-SSR遗传差异性分析被引量：5
《中国农学通报》2019年第19期49-57,共9页董黎 张江涛 文彦忠 牛东升 田书勇 孙宇涵 李云 
北京林业大学重大科研成果培育项目“刺槐种质资源评价、品种选育与产业化应用”(2017CGP007);林业公益性行业科研专项“刺槐属种质资源收集保存与创新利用研究”(201304116);国家林业局科技发展中心项目“北林槐1号新品种转化应用试点”(XPC-2015-3);国家林业局科技推广项目“四倍体刺槐扦插繁殖方法推广示范”([2015]53号);中央高校基本科研业务费专项资金资助“重要生态抗逆树种育种与高效繁殖技术”(2016BLPX13);国家自然科学基金项目“刺槐不去雄条件下实施控制授粉的花粉竞争与子代选择机制”(31570677)
为在刺槐育种研究中合理选用不同来源的SSR分子标记,选取12个刺槐个体,试剂盒提取DNA后分别利用9对Genomic-SSR引物和9对EST-SSR引物进行扩增,并采取毛细管电泳检测扩增产物。利用所得条带信息及相关软件对2种SSR分子标记进行多态性、...
关键词：刺槐 GENOMIC-SSR EST-SSR 遗传相似系数 遗传差异性 
SSR fingerprinting of 203 sweetpotato (Ipomoea batatas (L.) Lam.) varieties被引量：11
《Journal of Integrative Agriculture》2018年第1期86-93,共8页MENG Yu-sha ZHAO Ning LI Hui ZHAI Hong HE Shao-zhen LIU Qing-chang 
supported by the earmarked fund for the China Agriculture Research System (CARS-11);the National Natural Science Foundation of China (31461143017);the Science andTechnology Planning Project of Guangdong Province,China (2015B020202008)
Simple sequence repeat （SSR） markers have been shown to be a powerful tool for varieties identification in plants. How- ever, SSR fingerprinting of sweetpotato varieties has been a little reported. In this study, a ...
关键词：EST-SSR fingerprinting genetic distance GENOMIC-SSR SWEETPOTATO 
桉树Genomic-SSR和EST-SSR分子标记的遗传差异性分析被引量：4
《桉树科技》2017年第3期1-8,共8页刘果 谢耀坚 陈鸿鹏 吴志华 
中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金(CAFYBB2016MB004)
为探讨Genomic-SSR与EST-SSR标记在桉树种间的遗传差异,本研究利用两种不同来源的SSR标记对6种桉树进行遗传差异性分析。分析结果表明:Genomic-SSR标记在6种桉树中具有高的遗传多样性,EST-SSR标记在揭示不同基因型间遗传关系方面更具优...
关键词：桉树 GENOMIC-SSR EST-SSR 遗传差异性 
鸭茅基因组Genomic-SSR标记开发被引量：5
《分子植物育种》2017年第10期4071-4079,共9页李季 黄琳凯 金梦雅 冯光燕 赵欣欣 聂刚 潘玲 唐露 张新全 
国家重点基础研究发展计划(973计划)(No.2014CB138705);国家牧草产业体系(CARS-35-05);国家自然科学基金(NSFC 31372363)共同资助
鸭茅是重要的冷季型禾本科牧草,而优质分子标记的缺乏制约了鸭茅分子育种的进程。本研究从鸭茅基因组序列中鉴定出78 984个SSR位点,其中单核苷酸、二核苷酸和三核苷酸的SSR类型共占98.1%。共鉴定出212种重复基元,A/T、AG/CT、CCG/CGG、A...
关键词：SSR标记 基因组 鸭茅 GENOMIC-SSR EST-SSR 
Genomic-SSR和EST-SSR在柱花草种间的遗传差异被引量：6
《广东农业科学》2015年第14期106-113,共8页丁西朋 罗小燕 邵辰光 张龙 王文强 白昌军 
海南省自然科学基金(313067);中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金(1630032013002);国家现代产业体系牧草岗位科学家经费项目
为了探讨genomic-SSR与EST-SSR标记在柱花草种间的遗传差异,利用两种SSR标记技术,对来自不同种的12份柱花草种质进行了遗传分析,并对两种不同标记进行比较。结果表明:EST-SSR标记相比genomic-SSR在柱花草不同种间具有更好的通用性,EST-...
关键词：柱花草 EST-SSR GENOMIC-SSR 遗传差异 
苎麻Genomic-SSR与EST-SSR分子标记遗传差异性分析被引量：4
《中国麻业科学》2015年第2期57-63,共7页刘晨晨 栾明宝 陈建华 王晓飞 许英 孙志民 
国家自然科学基金(31471547;30900913);湖南省自然科学基金(13JJ4116);国家科技支撑计划(2013BAD01B03-13)
为了明确苎麻不同SSR的遗传差异性,利用Genomic-SSR与EST-SSR两种SSR标记对19个苎麻核心种质的遗传多样性进行分析。根据统计结果,Genomic-SSR平均检测到的观测等位基因数为3.4643、有效等位基因数为2.1982、Shannon多样性指数为0.8864...
关键词：苎麻 遗传差异性 分子标记 GENOMIC-SSR EST-SSR 
鹅掌楸Genomic-SSR反应体系优化被引量：6
《林业科学研究》2013年第4期506-510,共5页贾波 徐海滨 徐阳 龙晓飞 陈金慧 施季森 
国家高技术研究发展计划(863计划)资助(课题编号:2013AA102705);国家自然基金(31170619)
鹅掌楸属（Liriodendron L）,是木兰科（Magnoliaceae）植物,属古老属种之一。由于第三纪晚期气候剧变和更新世冰川作用,到目前为止仅剩中国马褂木（L.chinense（Hemsl.）Sarg.）和北美鹅掌楸（L.tulipifera L.）两个残遗种[1]。鹅掌楸...
关键词：GENOMIC-SSR 鹅掌楸 正交试验 单因素梯度试验 
桉树Genomic-SSR和EST-SSR引物的快速筛选与通用性研究被引量：12
《林业科学》2013年第2期127-133,共7页刘果 张党权 谢耀坚 谷振军 章怀云 
林业公益性行业科研专项(201104003);863计划课题(2011AA100202);湖南省科技厅重点项目(2010NK2008,2011NK2019);广东省林业创新专项(2011KJCX019)
桉树是桃金娘科（Myrtaceae）桉属（Eucalyptus）、杯果木属（Angophora）和伞房属（Corymbia）3个属的树种总称,约有945种。桉树具有生长迅速、轮伐期短、耐干旱、耐贫瘠、适应性广等优良特性,且用途广、经济效益高,因此,桉树现已被世...
关键词：SSR标记 桉树 引物筛选 基因组DNA混合池 
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