简单序列重复

作品数：146被引量：988H指数：17
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SSR标记引物及其在识别茶树“信阳10号”上的应用
《信阳师范大学学报(自然科学版)》2025年第1期17-23,共7页毛光志 李梦笛 朱国金 陈震 衡双平 张伟 周棋赢 袁红雨 江昌俊 邢锋 
国家自然科学基金项目(22208276);科技部重点专项项目(2021YFD1601100);河南省中央引导地方科技发展资金项目(Z20231811160);河南省高等学校重点科研项目(22A210023);信阳师范大学“南湖学者奖励计划”青年项目(2020B12)。
针对基于表型或生化成分在茶树种质间不易识别“信阳10号”品种问题,采用基于茶树品种“舒茶早”基因组数据,开发SSR分子标记引物对茶树种质基因分型的方法,研究了在茶树种质间识别“信阳10号”。用随机挑选的SSR标记引物,对随机挑选的...
关键词：茶树 种质识别 简单序列重复 “信阳10号” 
蔗茅全基因组SSR标记特征分析与开发
《中国农业科学》2025年第5期851-863,I0001-I0003,共16页罗正英 胡鑫 吴转娣 钱禛锋 田春艳 刘新龙 李富生 
云南省农业科学院科研项目(2024KYZX-03);云南省种子种业联合实验室项目(202205AR070001-09)。
【目的】蔗茅(Erianthus fulvus)是甘蔗重要的野生资源,可用于改良品种的抗逆性和产量。系统鉴定和开发蔗茅基因组中的简单重复序列(simple sequence repeat,SSR)位点,筛选可利用的多态性SSR标记,解析蔗茅资源的遗传多样性特征,开发重...
关键词：蔗茅 基因组 简单序列重复 特异扩增 多态性分析 
基于SLAF-seq技术的山桐子SSR标记开发及应用被引量：1
《分子植物育种》2024年第12期3929-3938,共10页邱文明 严莉 仝铸 苏春莉 何秀娟 肖翠 王泽琼 周明芹 袁龙义 孙中海 
湖北省农业科技创新中心资助项目(2019-620-000-001-23);湖北省农业科学院青年拔尖人才计划项目(Q20-18028)共同资助。
为开发山桐子(Idesia polycarpa Maxim.)简单序列重复(simple sequence repeat,SSR)分子标记,本研究构建了山桐子特异性位点扩增片段测序(specific-locus amplified fragment sequencing,SLAF-seq)数据库。基于多态性SLAF标签序列,利用M...
关键词：山桐子 简单序列重复(SSR) 简化基因组测序(SLAF-seq) 
基于SSR标记的百合资源遗传背景分析被引量：2
《生物工程学报》2024年第4期1211-1224,共14页韩嘉琪 王海平 宋江萍 贾会霞 张晓辉 李森 徐楚 李芝洁 阳文龙 
国家重点研发计划(2021YFD1200200);农业农村部作物种质资源安全保存项目(2023NWB037)。
为研究百合(Lilium spp.)种质资源的遗传背景,精准评价和筛选优异种质用于百合的遗传改良,本研究采用简单序列重复(simple sequence repeat,SSR)分子标记技术对来自我国11个省份的62份百合种质资源进行了遗传背景分析。结果表明,83对百...
关键词：百合 种质资源 遗传背景 简单序列重复(SSR) 
甜瓜皱叶基因wl的遗传分析与定位
《分子植物育种》2024年第5期1480-1487,共8页苏比娜·肖克来提 李群 鲁思梦 宁雪飞 周继阳 阮悦 康彩彦 王贤磊 
国家自然科学基金项目(31660297);新疆维吾尔自治区高校科研计划项目(XJEDU2021Y010);自治区天池博士计划科研启动项目(TCBS202034)共同资助。
甜瓜叶片是进行光合作用的主要器官,其形态对甜瓜果实可溶性固形物(糖度)含量高低产生影响显示为了遗传分析与定位甜瓜皱叶基因wl和叶形性状与果实糖度之间的关系,本研究以甜瓜‘西州蜜25号’(X25)(皱叶)为母本,‘伽师’(平叶)为父本构...
关键词：甜瓜 皱叶 基因定位 简单序列重复 
桤木Genomic-SSR与EST-SSR分子标记的差异分析
《四川林业科技》2023年第4期36-42,共7页王泽亮 杨勇智 杜晋城 陈炙 黄振 郭洪英 
世界银行贷款长江流域上游森林生态系统恢复项目(2019-510000-02-01-400761);四川省科技计划项目(2021YFYZ0032)。
桤木(Alnus cremastogyne)为非豆科固氮树种,也是我国最重要的一个桤木属特有种,具有重要的生态功能。本文分析了桤木基因组SSR与EST-SSR两种来源标记的遗传差异,结果显示EST-SSR的平均等位基因数与平均有效等位基因数高于Genomic-SSR,...
关键词：桤木 简单序列重复 遗传多样性 多倍体 GenoDive 
九里香全长转录组测序分析
《中国现代中药》2023年第7期1505-1514,共10页梁细妹 梁莹 韦坤华 秦双双 胡营 韦桂丽 韦筱媚 韦范 缪剑华 
广西创新驱动发展专项(桂科AA18242040);广西自然科学基金项目(2020GXNSFBA159018,2020GXNSFAA297069);国家中医药管理局中医药创新团队及人才支持计划项目(ZYYCXTD-D-202005);广西农业科技创新联盟项目(桂农科盟202211);科技基础资源调查专项(2018FY100700);对发展中国家科技援助项目(KY201904001);广西科技计划项目(桂科AD22080012)。
目的:获得九里香Murraya exotica L.Mant.全长转录组数据库,为深入挖掘其全长基因信息提供参考。方法:利用Pacino Sequel平台的第三代测序技术,对九里香的根、茎、叶、花、果混合样品进行全长转录组测序,并对原始转录组数据进行分析。结...
关键词：九里香 单分子实时测序技术 简单序列重复标记 功能注释 
广西莪术全长转录组测序及生物信息学分析被引量：1
《中国现代中药》2023年第7期1417-1427,共11页胡营 彭玉德 雷明 唐美琼 梁莹 韦筱媚 缪剑华 
广西创新驱动发展专项(桂科AA18242040);广西中医药管理局自筹经费科研课题(GXZYA20220006);广西科技创新联项目(桂科202211)。
目的:获取广西莪术的全长转录组信息,了解其转录组的整体水平,挖掘姜黄素类生物合成通路基因。方法:利用Pacbio Sequel测序平台对广西莪术根、茎、叶、花4个部位的混合样品进行全长转录组测序,结合生物信息学等方法进行功能注释、代谢...
关键词：广西莪术 全长转录组 功能注释 简单序列重复 
青稞遗传多样性及其农艺性状与SSR标记的关联分析被引量：5
《云南农业大学学报（自然科学版）》2023年第1期1-8,共8页王国平 胡再青 徐冬丽 张忠广 周喜荣 郭建炜 刘梅金 
国家现代农业产业技术体系专项(CARS-05);甘肃省小杂粮新品种选育与示范(18ZD2NA008);甘南州科技计划项目(2022JY1NC001);甘肃省科技计划(技术创新引导计划)项目-农业类-科技特派团专项(22CX8NP248)。
[目的]为青稞杂交组合选配和分子标记辅助选择育种奠定基础。[方法]利用简单序列重复(simple sequence repeat,SSR)分子标记分析39份青稞亲本材料间的遗传多样性,测量青稞亲本材料的株高、小穗密度、分蘖数、单株粒数和千粒质量等5个主...
关键词：青稞 简单序列重复(SSR) 遗传多样性分析 农艺性状 关联分析 
毛细管与聚丙烯酰胺凝胶电泳检测甜菜SSR位点的比较研究被引量：3
《中国农学通报》2022年第36期34-41,共8页冯琬淇 张福顺 刘乃新 
财政部和农业农村部国家现代农业产业技术体系(糖料)建设项目“质量安全与营养品质评价”(CARS-170503)。
为了探究毛细管与聚丙烯酰胺电泳方法的适用情况,比较其优缺点。本研究以8个甜菜栽培种资源为材料,选择8个SSR位点,分别使用聚丙烯酰胺凝胶电泳银染检测和毛细管电泳荧光检测每个位点的多态性,并对这两种方法的检测结果进行了比较。毛...
关键词：甜菜 简单序列重复 聚丙烯酰胺凝胶电泳 毛细管电泳 DNA片段 
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