大鲵Tafazzin基因及其全长cDNA的克隆及序列分析  

Molecular cloning and sequence analysis of Tafazzin gene in Andrias davidianus

作　　者：田海峰[1] 孟彦[1] 曾令兵[1] 肖汉兵[1] 

机构地区：[1]中国水产科学研究院长江水产研究所,武汉430223

出　　处：《淡水渔业》2013年第B07期3-7,共5页Freshwater Fisheries

基　　金：长江水产研究所所长基金（SZ2012-02）

摘　　要：实验采用兼并性PCR和末端快速扩增（RACE）的方法，得到了1432bp的大鲵AndriasdavidanusTAZ基因全长cDNA序列。该序列包括87bp的5’末端非翻译区（UTR），534bp的3’UTR及789bp的开放阅读框（ORF），NCBI数据库接收号KFll2047，编码263个氨基酸，预测其蛋白质分子量约为30．55KD，等电点约为8．87。通过搜索NCBI的nr数据库获取同源序列进行氨基酸相似性比对，并构建TAZ氨基酸序列的系统进化树，结果表明，大鲵TAZ与斑马鱼（Daniorerio）、爪蟾（Xenopustropicalis）、人（Homosapiens）等的TAZ蛋白同源性在68％～80％之间，在系统树上也与爪蟾关系最近，处于鱼类与爬行动物、鸟类及哺乳动物之间，反应了大鲵在进化上的过渡状态。To study the relationship between Tafazzin gene （TAZ） and the difference of growth rate in Andrias davidianus , 1432 bp full -length cDNA containing 87 bp 5＂UTR, 534 bp 3＂UTR and 789 bp open reading frame （ORF） was ob- tained by using degeneracy primer and RACE -PCR. GenBank number was （KF112047） . This sequence encoded 263 a- mino acids, and molecular weight was 30. 55 KD, and PI was about 8.87. Comparing with homologus obtained through searching against NCBI nr database and multiple sequence alignments, and following phylogeny analysis, it was showed that： the TAZ ofA. davidianus was similar with that ofDanio rerio, Xenopus tropicalis and Homo sapiens （68% -80% ）, and was clustered with Xenopus tropicalis on the phylogenetic tree, which represented the transitional state of A. davidianus.

关 键 词：大鲵(Andrias davidanus) TAFAZZIN 全长CDNA 系统发生分析 

分 类 号：S917.4[农业科学—水产科学]