栉孔扇贝内参基因稳定性研究  

Study on the Expression Stability of Reference Genes in Chlamys Farreri

作　　者：刘颖[1,2] 王双耀[1] 高乔[1] 安立会[2] 张鹏[1] 孙静娴[1] 姜志强[1] 郑丙辉[2] 

机构地区：[1]大连海洋大学水产与生命学院,大连116023 [2]中国环境科学研究院国家环境保护河口与海岸带重点实验室,北京100012

出　　处：《生态毒理学报》2013年第4期616-622,共7页Asian Journal of Ecotoxicology

基　　金：国家自然科学基金(21177117);国家科技支撑计划(2010BAC69B02)

摘　　要：合适的内参基因对准确定量目标基因表达水平非常重要。利用实时定量聚合酶链式反应(RT-qPCR)分析了不同发育阶段和雌激素暴露条件下栉孔扇贝性腺组织中β-actin、β-TUB、EF-lα、18SrRNA和GAPDH5个内参基因的表达水平,并利用RefFinder软件对其表达稳定性进行了分析。结果表明:在所考察的内参基因中,EF-lα在栉孔扇贝不同发育阶段和雌激素暴露下的表达均最为稳定,可作为定量目标基因表达水平的内参基因之一。Appropriate reference gene is very important to precisely quantify the target gene expression. In this present study, five reference genes mRNA expressions, including β-actin, β-TUB, EF-l α, 18S rRNA and GAPDH in Chlamys Farreri gonad , were quantified using real-time quantitative polymerase chain reaction （RT-qPCR）. Their expression stability was analyzed online using RefFinder software. The results showed that EF-l α expression was the most stable among these five reference genes in gonad of different development stages and estrogen exposure, suggesting that EF-lα is one of suitable reference gene for quantifying genes expressions in Chlamys Farreri gonad.

关 键 词：内参基因 栉孔扇贝 实时定量PCR(RT-qPCR) RefFinder EF-1 α 

分 类 号：X171.5[环境科学与工程—环境科学]