烟草黄瓜花叶病毒湖北分离物全基因组序列分析及亚组鉴定  

Complete Sequence Analysis and Subgroup Identification of Cucumber mosaic virus from Nicotiana tabacum in Hubei

作　　者：金大伟[1,2] 罗朝鹏[1] 杨军[1] 侯明生[2] 王燃[1] 李锋[1] 魏春阳[1] 武明珠[1] 魏攀[1] 林福呈[1] 

机构地区：[1]中国烟草总公司郑州烟草研究院 [2]华中农业大学植物科技学院,武汉市洪山区狮子山街1号430070

出　　处：《烟草科技》2014年第1期80-84,共5页Tobacco Science & Technology

基　　金：国家烟草专卖局科技项目和郑州烟草研究院科技项目"烟草主要病毒病分子变异监控及追踪技术研究"(122009CZ0410)

摘　　要：为明确我国湖北烟区烟草黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic virus,CMV)的亚组类型,对湖北地区侵染烟草的CMV HB24株系进行基因组全长克隆和序列分析。结果表明,HB24株系RNA1(GenBank序列号:KC019299)全长为3363个核苷酸(nt),编码993个氨基酸的1a蛋白;RNA2(GenBank序列号:KC019300)全长为3049nt,编码859个氨基酸的2a蛋白和111个氨基酸的2b蛋白;RNA3(GenBank序列号:KC019301)全长为2216nt,编码279个氨基酸的3a蛋白和218个氨基酸的CP蛋白。核苷酸序列同源性分析表明,HB24与Fny,SD和Q株系RNA1同源性分别为91.6%,91.1%和75.9%,RNA2同源性分别为91.8%,97.8%和69.5%,RNA3同源性分别为92.1%,93.4%和73.2%;与同属花生矮化病毒(Peanut stunt virus,PSV)ER株系RNA1,RNA2和RNA3的同源性分别为65.5%,56.7%和54.1%,与同属番茄不孕病毒(Tomato aspermy virus,TAV)V株系同源性分别为66.9%,57.7%和51.5%。HB24 RNA3 5′NTR(Nontranslated region)的结构分析以及RNA3 5′NTR和CP基因核苷酸序列系统进化树的分析表明,HB24属于CMV亚组IB。In order to identify the subgroup type of CMV （Cucumber mosaic virus） in Hubei tobacco, CMV HB24 strain was isolated, and the full-length cDNA sequence of genomic RNAs of the isolate was determined by RT-PCR and sequence analysis. The results showed that： HB24 RNA1 （GenBank： KC019299） consisted of 3363 nucleotides （nt） and encoded la protein of 993 amino acid residues （aa）, RNA2 （GenBank： KC019300） consisted of 3049 nt and encoded 2a protein of 859 aa and 2b protein of 111 aa, RNA3 （GenBank： KC019301） contained 2216 nt and encoded 3a protein of 279 aa and CP of 218 aa. The results of nucleotide sequence similarity indicated that： the similarities of HB24 RNAs with the RNAs of Fny, SD, Q strains were： RNAI： 91.6%, 91.1%, 75.9%; RNA2： 91.8%, 97.8%, 69.5%; RNA3： 92.1%, 93.4%, 73.2%, respectively. The similarities of HB24 RNAs with the RNAs of PSV-ER （Peanut stunt virus） were RNAI： 65.5%, RNA2： 56.7%, RNA3： 54.1%; and that with the RNAs of TAV-V （Tomato aspermy virus） were 66.9%, 57.7%, 51.5%, respectively. According to RNA3 5＇ NTR （Nontranslated region） structure analysis, and phylogenetic tree analyses of RNA3 5＇ NTR and CP gene nucleotide sequences, HB24 belonged in CMV IB subgroup.

关 键 词：黄瓜花叶病毒 基因组 同源性 系统进化树 

分 类 号：S432.41[农业科学—植物病理学]