用基因芯片的方法对人酪蛋白激酶CK1γ1基因进行表达谱和聚类分析  

Expression Pattern and Gene Clustering Analysis of Human Casein Kinase CK1 γ1 cDNA by Using cDNA Microarray Hybridization

作　　者：唐榕[1] 应康[1] 陈宣茂[1] 孙朝辉 石军[2] 吴超群[1] 黄燕[1] 刘建平[1] 李瑶[1] 谢毅[1] 毛裕民[1] 

机构地区：[1]复旦大学生命科学学院遗传学研究所,上海200433 [2]第三军医大学附属肿瘤新桥医院神经外科,重庆400037

出　　处：《复旦学报（自然科学版）》2000年第6期618-622,共5页Journal of Fudan University：Natural Science

基　　金：上海市现代生物与新药产业发展基金资助项目!(98431912 1)

摘　　要：将人酪蛋白激酶基因CK1γ1的cDNA与 40 96个胎脑cDNA一起点在玻璃介质的基因芯片上 ,用 16种不同组织或细胞系的mRNA分别杂交该基因芯片 ,以正常人混合组织mRNA作共同对照 ,检测CK1γ1基因的表达谱变化 ,结果显示人CK1γ1基因在 15种组织表达没有变化 ,但在肝癌组织中的表达却显著下调 .采集的 7例肝癌标本的cDNA与正常肝组织的cDNA重复 7次芯片杂交 ,结果肯定了CK1γ1基因在肝癌组织中表达下调 .同时 ,对芯片杂交结果通过聚类分析 ,按基因表达谱特征将CK1γ1基因与其他 7种基因聚类在一起 ,提示CK1γ1基因可能在生物学作用方面与这 7种基因有某种相关性 .The cDNA microarray was used to analyze the expression profile of human CK 1 γ 1 cDNA cloned among 16 different tissues or cell lines. The result showed that human CK 1 γ 1 gene expressed at low level in hepatoma as compared with other tissues. 7 cases of repeated hybridization with array using cDNAs coming from hepatoma and normal liver respectively confirmed that the expression of human CK 1 γ 1 gene was specifically down regulated in hepatoma. Expression pattern based gene clustering has clustered CK 1 γ 1 with other seven genes, which suggests the possible functional co relationships among them.

关 键 词：CK1γ1基因 基因芯片 表达谱 基因聚类 人酪蛋白激酶 

分 类 号：Q523.03[生物学—生物化学] Q555.7