全转录组测序技术及其在白血病和淋巴瘤研究中的应用  

RNA-Seq and its applications in leukemia and lymphoma

作　　者：李景岗[1] 王少元[1] 吴小南[1] 

机构地区：[1]福建医科大学附属协和医院病理科,福州350001

出　　处：《国际遗传学杂志》2014年第3期124-128,147,共6页International Journal of Genetics

基　　金：基金项目：福建省教育厅重点项目（JA11108）

摘　　要：转录组是特定组织或细胞在某一发育阶段或功能状态下转录出来的所有RNA的集合。转录组研究能够从整体水平研究基因结构以及基因功能，揭示特定生物学过程以及疾病发生过程中的分子机制。全转录组测序技术（RNA—Seq）利用第二代高通量测序技术对一组织或细胞中所有RNA反转录而成的cDNA文库进行测序，通过对测序系列的拼接、组装以及与参考序列的比对分析，不仅可以确定转录本位置、单个核苷酸变异、剪切变异，还可以发现新的转录本以及进行基因表达的定量分析。RNA—Seq作为一种新的高效快捷的转录组研究技术，已广泛应用于生物学研究、医学研究等。该文就RNA—Seq技术原理、技术特点及其在白血病和淋巴瘤相关基因研究中应用作一简要综述。The transcriptome is the complete set of transcripts for certain type of cells or tissues in a specific developmental stage or physiological condition. Transcriptome analysis can provide a comprehensive understanding of molecular mechanisms involved in specific biological processes and diseases from the information on gene structure and function. RNA-seq, refers to the use of next-generation highthroughput sequencing technologies to sequence cDNA library transcribed from all RNAs in tissues or cells, can be used to quantify, profile, and discover RNA transcripts by Sequencing, assembling, mapping reads. RNA-Seq, as a new efficient and fast transcriptome sequencing technology, has been widely used in biological, medical research. The detailed principles, technical characteristics and applications of RNA- seq in leukemia and lymphoma are reviewed here.

关 键 词：转录组测序(RNA—Seq) 白血病 淋巴瘤 

分 类 号：R733.7[医药卫生—肿瘤] R733.1[医药卫生—临床医学]