肝癌微环境中影响转移相关通路的基因富集分析  

Applying gene expression profile analysis to screen pivotal genes controlling the venous metastasis of hepatocellular carcinoma

作　　者：高丹[1] 涂振霄[1] 张贯启[1] 吴俣[1] 倪亚安 张志伟[1] 

机构地区：[1]华中科技大学同济医学院附属同济医院肝脏外科湖北省肝脏外科临床研究中心,武汉430030

出　　处：《腹部外科》2014年第3期182-185,共4页Journal of Abdominal Surgery

基　　金：1.国家自然科技基金（81272421）;2.病毒性肝炎相关肝癌综合治疗规范化、个体化和新策略的研究的子课题“十二五”国家科技重大专项项目（2012ZX10002016-004）;3.多途径提高肝癌外科治疗效果的前瞻性随机对照临床研究（201043901,No.439-51,2010）;4.武汉市科技局科技攻关计划项目：多途径提高大肝癌手术疗效的研究（201260523171-4）

摘　　要：目的 探讨肝癌微环境对肝癌发生门静脉转移起重要作用的基因簇或通路,为肝癌的治疗和研究提供理论依据.方法 利用基因组富集（GSEA）的方法,对美国国家生物技术信息中心（NCBI）的综合性的基因表达与杂交排序数据库（GEO数据库）中的11例肝癌无门静脉癌栓（PVTT）和9例肝癌合并PVTT的癌旁相对正常组织基因表达谱芯片进行分析,分析其在肿瘤相关通路中的富集特征与核心富集基因.结果 找到15条相关的信号通路,这些通路与癌旁微环境中的免疫功能状态有关,对于肝癌发生PVTT转移可能起重要作用.结论 肝癌发生门静脉转移除了与肿瘤细胞本身的恶性增殖和侵袭有关以外,还与周围微环境中的免疫状态和炎症反应有重要联系.Objective To investigate the genetic mechanism for the development of portal vein tumor thrombus （PVTT） in hepatocellular carcinoma（HCC） patient.Methods Gene chip was down loaded from the GEO（gene omnibus） database（accession number is GSE5093）,which were analyzed by gene set enrichment analysis （GSEA）.20 noncancerous surrounding hepatic tissues from two HCC patient groups,containing 9 primary HCC with venous metastasis and 11 HCC without detectable PVTT metastasis.Results A total of 15 genes and pathways associated with PVTT of HCC were i dentified,mainly including cell inflammation factors,cell immune functions,cell apoptosis,graft ver sus host disease and so on.Conclusions Cell Immune and inflammation response are closely related with PVTT in HCC.

关 键 词：癌 肝细胞 多基因族 肿瘤微环境 基因富集 

分 类 号：R735.7[医药卫生—肿瘤]