两种相邻分布的水稻U14 BoxC/D snoRNA  

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作  者:江舸[1] 徐丰[1] 金由辛[1] 王德宝[1] 

机构地区:[1]中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所分子生物学国家重点实验室,上海200031

出  处:《自然科学进展(国家重点实验室通讯)》2001年第10期1055-1061,共7页

基  金:中国科学院"十五"创新项目(KSCX2-2-04);中国科学院上海生命科学院项目资助

摘  要:通过对酵母U14 BoxC/D snoRNA保守元件的分析,推测出水稻BoxC/DsnoRNA可能具有的保守序列,进而在水稻第二号染色体上找到可能编码两种BoxC/D snoRNA的序列。这两个BoxC/D snoRNA在染色体上相邻分布,具有典型的BoxC和BoxD序列,末端形成茎环结构,这也是BoxC/D snoRNA一个显著的特点,它们含有一段相同的“引导”序列,此序列能与水稻18S核糖体RNA(rRNA)第414位到第427位互补配对,这两者可能行使相同的功能:介导此配对区域内rRNA的核糖的甲基化,通过实验证明:(1)水稻18S核糖体RNA的配对区域内的确存在甲基化修饰;(2)这两种BoxC/D snoRNA存在于水稻细胞中,通过序列同源性比较发现与玉米U14 snoRNA有很高的同源性,将这两种在水稻中发现的BoxC/D snoRNA命名为U14.1 snoRNA和U14.2 snoRNA,编码这两种BoxC/D snoRNA的基因已被GenBank收录,其编号为AF332622。

关 键 词:水稻 BoxC/DsnoRNA 核糖体RNA 甲基化 核仁小分子RNA 染色体 相邻分布 序列同源性 

分 类 号:S511[农业科学—作物学] Q522[生物学—生物化学]

 

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