登革病毒GD01/98结构蛋白基因序列及蛋白二级结构初步分析  

The Nucleotide Sequence and Secondary Structure of the Structural Protein of Dengue Virus GD01/98 Strains

作　　者：张勤奋[1] 陈森雄[1] 蒋廉华[2] 卢炘英[1] 张景强[1] 

机构地区：[1]中山大学生物防治国家重点实验室,广东广州510275 [2]广州军区军事医学研究所,广东广州510507

出　　处：《中山大学学报（自然科学版）》2002年第2期72-75,共4页Acta Scientiarum Naturalium Universitatis Sunyatseni

基　　金：国家自然科学基金资助项目 (39770 16 1);广东省自然科学基金资助项目 (970 149);全军医药卫生科研基金资助项目 (0 1Z0 14)

摘　　要：对登革病毒GD0 1 98结构蛋白基因采用RT -PCR、分子克隆等方法进行测序 ,获得了分离株的结构蛋白基因核苷酸序列 2 419bp ;并通过Internet、用Blast等软件进行同源性分析 ,发现它同泰国分离株最近 ,可能来源于泰国 ;根据核苷酸序列 ,推导蛋白一级结构 ,并用GOR、神经网络 (HierarchicalNeuralNetwork)等方法进行二级结构预测 ,发现有 46 74%氨基酸参与无规卷曲 ,有 31 16 %氨基酸参与α -螺旋 ,没有The sequence about 2 419 bp of the structural protein gene of Dengue Virus GD01/98 strain was obtained by using RT-PCR, Clone technology etc.It could be concluded that the strain might be Thailand resources for the nucleotide sequence has highest homologous with ThNH-7/93. The preliminary secondary structure was studied by Gibrat (GOR3) methods and Hierarchical Neural Network methods together with the internet. The results demonstrated that there were 46.74% random coils and 31.16% α-helix.

关 键 词：登革病毒 结构蛋白 核苷酸序列 蛋白二级结构 基因序列分析 急性传染病毒 

分 类 号：R373.33[医药卫生—病原生物学] Q518.1[医药卫生—基础医学]