蛋白质结构型预测的研究  

The Study of Protein Structural Class Prediction

作　　者：贾孟文[1] 李前忠[1] 

机构地区：[1]内蒙古大学物理学系,内蒙古呼和浩特010021

出　　处：《内蒙古大学学报（自然科学版）》2002年第3期276-279,共4页Journal of Inner Mongolia University：Natural Science Edition

基　　金：国家自然科学基金 ( 30 1 6 0 0 2 5 ) ;内蒙古自然科学基金 ( 2 0 0 1 0 90 1 -1 1 )

摘　　要：以 nα、nβ、nβαβ、n4α、n4β等五个二级结构参数为基础 ,用离散增量研究了蛋白质的聚类和蛋白质的结构型预测 .α型 ,β型和 αβ型可以很好地分别聚在三个大支中 .蛋白质结构型预测总体预测正确率为 82 % ,用 Self-consistency和 Jake-knife这两种方法测试的结果没有明显的差别 .从结果可以看出利用蛋白质的二级结构参数能较好地体现出各种结构型蛋白质的特点 .Based on secondary structural parameters n α?n β?n βαβ ?n 4α and n 4β , we use the method of increment of diversity to study the clustering and the structural class prediction of protein. The result of protein clustering shows that the α class, β class and αβ class in individual branch. The total rate of correct prediction of protein structural class is 82%. The result of self consistency test and jack knife test hasn′t difference. According to the result of protein clustering and protein structural class prediction , we suggested that the secondary structural parameters n α?n β?n βαβ ?n 4α and n 4β can represent the feature of protein structural classes.

关 键 词：二级结构参数 离散增量 蛋白质 聚类 结构型预测 二级结构序列 Α螺旋 Β折叠 

分 类 号：Q518.1[生物学—生物化学]