二级结构序列

作品数:13被引量:53H指数:3
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相关机构:内蒙古大学中国科学院中国科学院研究生院渤海大学更多>>
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蛋白质二级结构序列与残基种类间关联的分析
《池州学院学报》2015年第3期30-31,共2页汪一亭 
池州学院自然科学研究项目(2013ZR017)
基于生物实验理论,利用生物大分子数据库和软件技术比较研究了蛋白质二级结构序列和残基种类的数值规律,分析了二者在含量及位置方面的构效关系。由统计结果我们认为,由于不同残基的SASA属性、亲(疏)水性特征的差异,蛋白质序列的残基类...
关键词:蛋白质二级结构 Α-螺旋 Β-折叠 界面残基 非表面残基 表面疏水性 
基于蛋白质二级结构序列的结构型预测
《河北理工大学学报(自然科学版)》2008年第3期122-123,共2页王化坤 钱伟懿 
以蛋白质二级结构含量为基础利用Mahalanobis距离和以蛋白质二级结构序列建立数学模型相结合的方法来预测α型、β型、α+β型和α/β型四种蛋白质结构型。
关键词:蛋白质 二级结构含量 结构型 MAHALANOBIS距离 
rRNA二级结构序列用于真菌系统学研究的方法初探(英文)被引量:5
《菌物学报》2007年第1期22-31,共10页刘超洋 庄文颖 
National Natural Science Foundation of China (no. 30230020, 30470009)
本文首次利用核酸二级结构特征代替核酸碱基作为探讨类群之间亲缘关系的信号,构建了基于结构特征的子囊菌部分类群的系统进化树。该方法以S(规范的碱基对),Q(不规范的碱基对),I(单链),B(侧环),M(多分枝环)和H(发卡结构)为代码将二级结...
关键词:子囊菌门 亚结构类型 结构序列 系统演化信号 
蛋白质结构型的识别方法被引量:1
《生物化学与生物物理进展》2002年第6期938-941,共4页李晓琴 罗辽复 
国家自然科学基金资助项目 (3 9960 0 2 390 10 3 0 3 0 )~~
给出了α型、β型、α/ β型、多域型蛋白质二级结构主序列六联体的分布规律 .提出了根据蛋白质二级结构主序列对蛋白质结构型进行识别 (分类 )的方法 .以蛋白质二级结构主序列三联体为参数 ,利用Mahalanobis距离方法对上述 4种结构型...
关键词:蛋白质结构型 识别方法 二级结构序列 多样性指标 
蛋白质结构型预测的研究
《内蒙古大学学报(自然科学版)》2002年第3期276-279,共4页贾孟文 李前忠 
国家自然科学基金 ( 30 1 6 0 0 2 5 ) ;内蒙古自然科学基金 ( 2 0 0 1 0 90 1 -1 1 )
以 nα、nβ、nβαβ、n4α、n4β等五个二级结构参数为基础 ,用离散增量研究了蛋白质的聚类和蛋白质的结构型预测 .α型 ,β型和 αβ型可以很好地分别聚在三个大支中 .蛋白质结构型预测总体预测正确率为 82 % ,用 Self-consistency和...
关键词:二级结构参数 离散增量 蛋白质 聚类 结构型预测 二级结构序列 Α螺旋 Β折叠 
蛋白质的二级结构序列和结构型被引量:3
《内蒙古大学学报(自然科学版)》2002年第1期21-25,共5页李晓琴 王守源 罗辽复 
国家自然科学基金;内蒙古自然科学基金资助项目
从蛋白质的二级结构序列出发 ,提出了冗余的概念 ,定义了冗余数量和冗余长度 ,给出了不同结构型蛋白的冗余数量和长度的分布特性 .统计结果表明 α类蛋白中 30 %、β类蛋白中84 %、α/β类蛋白中 95 %的序列不同程度的存在冗余 ,冗余数...
关键词:二级结构序列 结构型 信息聚类 冗余结构 蛋白质 冗余数量 冗余长度 结构预测 
一种预测蛋白质结构型的新方法被引量:1
《内蒙古大学学报(自然科学版)》2002年第1期26-30,共5页吕志清 李前忠 
国家自然科学基金资助项目
基于蛋白质的结构类型决定于它的二级结构序列的概念 ,将蛋白质的二级结构含量和二级结构序列参数 Nα,Nβ,Nβαβ结合起来构成离散源 ,分别计算四种结构类型的标准离散量 D( Xα) ,D( Xβ) ,D( Xα/β) ,D( Xα+β) ,利用离散增量的概...
关键词:结构型 框架结构 二级结构序列 离散量 离散增量 蛋白质 结构预测 折叠模式 
蛋白质结构型的定义和识别被引量:5
《生物化学与生物物理进展》2002年第1期124-127,共4页李晓琴 罗辽复 
国家自然科学基金资助项目 (39960 0 23)~~
提出紧结构域的概念 ,由二级结构序列中一段或几段连续的α螺旋和 β折叠构成的空间紧密堆集的最大折叠体称为紧结构域 .利用 3种紧结构域 (α域 ,β域和α/β域 )定义球蛋白的 5种结构型 :α型蛋白 ,β型蛋白 ,α/β型蛋白 ,多域蛋白和...
关键词:蛋白质结构型 二级结构序列 紧结构域 序列冗余 预测 识别 
用离散量预测蛋白质的结构型被引量:32
《生物物理学报》2001年第4期703-712,共10页吕志清 李前忠 
国家自然科学基金资助项目(39660023)
基于蛋白质的结构类型决定于它的二级结构序列的概念,用二级结构序列参数Nα,Nβ,Nβαβ,N(βαβ)构成离散源,并计算离散量D(Xα),D(Xβ),D(Xα/β),D(Xα +β),利用离散增量预测蛋白质的结构类型,它是由这个蛋白质的离散量D(Xn)与四...
关键词:结构型 框架结构 二级结构序列 离散量 离散增量 蛋白质 
α类蛋白的构建模式及拓扑结构预测
《内蒙古大学学报(自然科学版)》1999年第3期325-328,共4页李晓琴 罗辽复 
国家自然科学基金
给出了α类蛋白的构建规则,指出了螺旋片段的长短是决定相邻两个片段取向的重要原因.讨论了4螺旋束的构建及理论模式,对α类蛋白的分类进行了补充。
关键词:α类蛋白 拓扑结构 二级结构序列 蛋白质 分类 
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