新疆天然胡杨林地区根际微生物的种群分析  

Analysis of bacterial community isolated from rhizosphere of the natural euphrates poplar forest, Xinjiang

作　　者：程冬梅[1] 唐雅丽[1] 张坤迪[2] 方呈祥[3] 

机构地区：[1]暨南大学水体富营养化与赤潮防治广东普通高校重点实验室,广州510632 [2]中国科学院青岛能源与过程研究所,青岛266101 [3]武汉大学生命科学技术学院,武汉430074

出　　处：《生态科学》2013年第6期711-717,共7页Ecological Science

基　　金：国家自然科学基金青年项目(31000219);广东省教育厅育苗工程项目(LYM10026)

摘　　要：在新疆塔里木河流域的现存世界上面积最大的天然胡杨林采集了根际土壤样品,共分离纯化得到140个菌株,并真空冷冻干燥保存于中国典型培养物保藏中心。随机选取其中53株细菌的基因组进行16S rDNA测序,并通过NCBI进行比对来初步鉴定。以16S rRNA基因相似性低于97%时作为不同的分类单元定义,这些菌株可以划分为47个不同的分类单元。系统发育树将这些菌株聚类于厚壁菌门、变形菌门、拟杆菌门、放线菌门和疣微菌门等5个门。其中优势种群为变形菌门(Proteobacteria)细菌。分离菌株中潜在的新分类单元(相似性<97%)所占比例较高,约占分离总数的26.4%。其中,菌株R37与T44相关的多相分类数据已经发表于国际系统与进化微生物学杂志上,分别代表了一个新属(Parasegetibacter luojiensis gen.nov.,sp.nov.)与一个新种(Niastella populi sp.nov.)。该研究一方面对胡杨林根际土壤可培养微生物进行了种群分析,了解了其微生物群落的多样性;另一方面获得了大量新的菌种资源,为进一步的开发利用提供条件。Totally 140 strains were isolated from rhizosphere soil of the world＇s largest natural euphrates poplar forest located in the Tarim River Basin, Xinjiang in this study. 53 of these strains were subjected to phylogenic analysis including 16S rDNA sequencing and nBlast. It was found that they were distributed in the 5 phyla, Firmicutes, Proteobacteria, Bacteroidetes, Actinobacteria and Verrucomicrobia. Two strains including R37 and T44（strains RHYL-37^T and THYL-44^T） were found to represent a novel genus（Parasegetibacter luojiensis gen. nov., sp. nov.） and a new species（Niastella populi sp. nov.） respectively according to polyphasic taxonomic data, which had already been published in International Journal of Systematic and Evolutionary. 26.4% of the isolates showed low similarity to the known strains（ 〈97%）, having the potential to represent new taxa.

关 键 词：胡杨林 根际微生物 种群分析 16SrDNA 

分 类 号：X172[环境科学与工程—环境科学]