A型产气荚膜梭菌青海分离株tetA(P)耐药基因序列分析及蛋白结构预测  

Sequence Analysis and Protein Structure Prediction of tetA(P) Resistance Gene of Clostridium perfringens Type A Qinghai Isolate

作　　者：冶贵生[1] 马玉花[1] 张爽[1] 张晓芬[1] 韩志辉[1] 邹勇[2] 贾跃宁 

机构地区：[1]青海大学农牧学院,青海西宁810016 [2]西北农林科技大学动物医学院,陕西杨凌712100

出　　处：《动物医学进展》2015年第6期54-59,共6页Progress In Veterinary Medicine

基　　金：国家自然科学基金项目(31160511);国家自然科学基金项目(31460672);青海大学"123高层次人才培养工程"项目

摘　　要：应用PCR技术对A型产气荚膜梭菌青海分离株的tetA(P)耐药基因进行扩增、测序,利用生物软件对tetA(P)基因进行序列分析与蛋白结构预测。结果表明,A型产气荚膜梭菌青海分离株的tetA(P)基因长度为1 263bp,编码420个氨基酸。与参考菌株EHE-NE18、Wakayama、CW92的核苷酸序列同源性依次为100%、99.8%和98.7%,氨基酸序列同源性依次为100%、100%和98.3%。分离株TetA(P)蛋白疏水性较强,具有10个跨膜区,含有4个N-糖基化位点,1个cAMP和cGMP依赖性蛋白激酶磷酸化位点,5个蛋白激酶C磷酸化位点,1个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点,1个酪氨酸激酶磷酸化位点,12个N-豆寇酰化位点,三级结构主要是由α-螺旋和无规则卷曲形成。研究结果可为A型产气荚膜梭菌tetA(P)基因功能研究提供依据。tetA（P） gene of Clostridiurn perfringens type A was amplified by PCR and sequened,and the protein structure of tetA（P） was predicted. The results showed that tetA（P） gene length was 1 263 bp, encoding 420 amino acids. Nueleotide sequence homologies of tetA（P） gene with reference strains EHE- NE18,Wakayama,CW92 were 100% ,99.8% ,98.7% respectively,and the amino acid sequence homologies were 100%,100%, 98. 3%, respectively. TetA（P） of isolate strain had strong hydrophobicity, 10 trans- membrane domains, 4 N-glycosylation sites, 1 cAMP- and cGMP-dependent protein kinase phosphorylation sites,5 protein kinase C phosphorylation sites, 1 casein kinase II phosphorylation sites, 1 tyrosine kinase phosphorylation site, 12 N-myristoylation sites, the research results can provide a basis for studing the tetA （P） gene function of Clostridium perfringens type A.

关 键 词：A型产气荚膜梭菌 tetA(P)基因 序列分析 蛋白结构 

分 类 号：S852.616.3[农业科学—基础兽医学]