药物研发领域中的开放访问数据库  

Open access databases in the field of drug discovery

作　　者：刘志海[1] 李婕[1] 韩莉[1] 李嫣[1] 刘杰[1] 聂伟[1] 刘宇晨[1] 王任小[1] 

机构地区：[1]生命有机化学国家重点实验室中国科学院上海有机化学研究所,上海200032

出　　处：《中国科学：化学》2015年第8期765-776,共12页SCIENTIA SINICA Chimica

基　　金：国家自然科学基金(81172984;21072213;21102168);国家高技术研究发展计划(2012AA020308)资助

摘　　要：开放访问数据库的发展极大推动了各领域的科学研究.本文以药物研发的几个代表性阶段为主线,介绍了该领域涉及的一批主流开放数据库,旨在为读者描绘药物研发领域值得关注的信息资源.另外,本文介绍了本课题组开发的PDBbind-CN数据库的构建过程和基本内容,这是一个致力于收集生物大分子复合物结构和亲合性数据的开放访问数据库,在药物分子设计领域中得到了国内外同行的广泛应用.Open access databases have been proved as a great aid to the research in many scientific areas. In this article, we review the main-stream open access databases at each major stage in the drug discovery pipeline. In particular, we describe the PDBbind-CN database developed by our group. It is a database linking the threedimensional structures and experimental binding data of biomolecular complexes, which has been applied by researchers worldwide in various molecular modeling or bioinformatics/cheminformatics studies.

关 键 词：药物研发 开放访问数据库 PDBbind-CN 亲合性数据 

分 类 号：TP311.13[自动化与计算机技术—计算机软件与理论] TQ460.1[自动化与计算机技术—计算机科学与技术]