王任小

作品数:21被引量:63H指数:5
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供职机构:中国科学院上海有机化学研究所更多>>
发文主题:药物组合物新型抗肿瘤药物类化合物抗肿瘤药物打分函数更多>>
发文领域:医药卫生理学化学工程自动化与计算机技术更多>>
发文期刊:《科研信息化技术与应用》《物理化学学报》《生物化学与生物物理进展》《生命科学》更多>>
所获基金:国家自然科学基金国家高技术研究发展计划上海市科学技术委员会资助项目国家杰出青年科学基金更多>>
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蛋白质-蛋白质相互作用的实验检测方法被引量:5
《上海大学学报(自然科学版)》2021年第1期106-116,共11页孔文娜 周宓 林海霞 王任小 
国家自然科学基金资助项目(81430083)。
生物体内的蛋白质分子常常通过与其他蛋白质分子发生相互作用来发挥其生物功能.因此,研究蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)对于阐明蛋白质分子的生物功能以及分子作用机理具有重要的意义.主要介绍基于生物物理...
关键词:蛋白质-蛋白质相互作用 生物物理方法 生物化学方法 
应用机器学习方法构建药物分子解离速率常数的预测模型被引量:5
《物理化学学报》2020年第1期179-187,共9页苏敏仪 刘慧思 林海霞 王任小 
中国科技部重点研发项目(2016YFA0502302);国家自然科学基金(81725022,81430083,21661162003,21673276,21472227,21472226);中国科学院先导项目(XDB20000000)资助.
越来越多的研究表明:药物分子与靶标分子的结合动力学性质与其在体内的药效有很强的相关性。因此,以改善结合动力学性质为导向的分子设计为药物研发提供了新的思路。本工作的研究目标在于得出预测药物分子解离速率常数(koff)的通用型定...
关键词:解离速率常数 配体结合动力学 随机森林模型 蛋白-配体相互作用 基于结构的药物设计 
构建药物-靶标亲合性打分函数的评价方法体系被引量:2
《中国科学:化学》2015年第9期949-960,共12页刘志海 李婕 韩莉 李嫣 王任小 
定量计算药物-靶标亲合性一直是分子靶向药物设计中的核心问题之一.亲合性打分函数适用范围宽、计算速度快且精度良好,特别适合与分子对接等方法联用,在药物研发中得到了广泛的应用.经过20多年的发展,目前存在数量繁多的打分函数,这些...
关键词:药物-靶标亲合性 打分函数 评价体系 CASF PDBbind-CN 分子靶向药物设计 
药物研发领域中的开放访问数据库被引量:1
《中国科学:化学》2015年第8期765-776,共12页刘志海 李婕 韩莉 李嫣 刘杰 聂伟 刘宇晨 王任小 
国家自然科学基金(81172984;21072213;21102168);国家高技术研究发展计划(2012AA020308)资助
开放访问数据库的发展极大推动了各领域的科学研究.本文以药物研发的几个代表性阶段为主线,介绍了该领域涉及的一批主流开放数据库,旨在为读者描绘药物研发领域值得关注的信息资源.另外,本文介绍了本课题组开发的PDBbind-CN数据库的构...
关键词:药物研发 开放访问数据库 PDBbind-CN 亲合性数据 
生物物理化学研究进展
《化学通报》2014年第7期699-702,共4页赵新生 高毅勤 黄岩谊 孙育杰 葛颢 王任小 徐平勇 尉志武 
生物物理化学是物理化学的一个相对新的分支,其进步迅猛,对推动生命科学的发展起到了重要作用。我国的生物物理化学家取得了一些具有世界影响的原创性研究成果,但是总体来说,我国生物物理化学学科的发展依然任重而道远。共引用参考文献3...
关键词:生物物理化学 进展 
靶向PRMT5先导化合物的筛选及其抗肿瘤作用探讨
《解剖学研究》2013年第3期200-202,224,共4页施晓柯 李婕 王任小 潘景轩 
目的筛选可能作用于PRMT5蛋白的化合物并检测其抗肿瘤作用。方法以PRMT5蛋白为靶标,通过虚拟筛选技术挑选并购买得到101种化合物样品;以MTS法筛选所有化合物对人慢性粒细胞白血病K562细胞生长的抑制作用并计算IC50值;以化合物处理K562细...
关键词:PRMT5蛋白 K562细胞系 H4RSDM甲基化蛋白 
一种计算水溶解度的经验加合模型的适用范围与局限(英文)
《物理化学学报》2012年第10期2249-2257,共9页段宝根 李嫣 李婕 程铁军 王任小 
supported by the National Natural Science Foundation of China(81172984,21072213,21002117,21102168,21102165);National High-Tech Research and Development Program of China(863)(2012AA020308)~~
我们发展了一种用于预测有机小分子化合物水溶解度(logS)的经验方法XLOGS.它本质上是一种加合模型,采用83种原子/基团类型和3个校正因子作为模型的描述符.该方法还可以根据一个合适的参照分子的logS实验值来计算未知化合物的logS值.我们...
关键词:水溶解度 加合法模型 XLOGS 
三种Bcl-2家族蛋白的表达、纯化及活性分析被引量:2
《生物医学工程学杂志》2010年第4期834-841,共8页朱翠侠 李勋 李雯雯 石志敏 周佳海 王任小 
国家自然科学基金资助项目(90813006;20621062);上海市科委资助项目(074319113)
Bcl-2家族蛋白(Bcl-xL、Bcl-2、Mcl-1等)是细胞凋亡、自吞噬等生命过程的重要调控因子,是近年来热门的抗肿瘤药物靶标。从文献报道的蛋白序列出发,克隆用于表达Bcl-2蛋白的人源Bcl-2/Bcl-xL嵌合基因以及用于表达Mcl-1蛋白的人源与鼠源Mc...
关键词:BCL-2家族蛋白 表达 纯化 荧光偏振 体外筛选 
有机化合物脂水分配系数和溶解度的计算方法被引量:13
《物理化学学报》2010年第7期1742-1754,共13页王艳玲 李婕 王任小 
国家高技术研究发展计划(863)(2006AA02Z337);“重大新药创制”科技重大专项(2009ZX09501-002)资助~~
有机化合物的脂水分配系数和溶解度在药物化学以及环境化学的研究中是十分重要的物理化学性质,在许多涉及有机化合物在生物体内的吸收、转运、代谢以及在环境中迁移等过程的定量构效关系研究(QSAR)中发挥着不可替代的作用.目前在实践中...
关键词:溶解度 脂水分配系数 药代动力学性质 logP/logD LOGS 
PDBbind数据库在计算机辅助药物设计中的应用
《科研信息化技术与应用》2009年第3期52-61,共10页刘志海 程铁军 王任小 
863目标导向类项目(2006AA02Z337)
本文首先回顾了e-Science的产生背景与内涵,分析了信息化技术在现代计算机辅助药物设计中的重要作用与意义。然后介绍本课题组科研工作的主要内容与框架,以PDBbind数据库的构建和开发为案例,阐明本课题组的信息化应用架构,介绍了一些基...
关键词:科研信息化 信息化平台 PDBbind数据库 计算机辅助药物设计 
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