荣昌猪miR-182基因序列多态性分析  被引量:1

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作  者:龙熙[1] 敖冯虎[1] 邱进杰[1] 王涛[1] 邱小田[1] 

机构地区:[1]重庆市畜牧科学院,四川荣昌402460

出  处:《中国畜牧杂志》2015年第21期15-19,共5页Chinese Journal of Animal Science

基  金:国家自然科学基金(31101701);重庆市基本科研业务费(2013cstc-jbky-00905;2012cstc-jbky-00901)

摘  要:实验旨在研究免疫相关基因miR-182的序列多态性,以期为荣昌猪抗病育种提供新的遗传变异素材。利用PCR、测序、序列多重比对、计算机模拟miRNA折叠、qRT-PCR等方法,分析了275头荣昌猪新生小猪的miR-182基因序列,计算了miR-182基因在荣昌猪群体中各基因频率和基因型频率,检验了miR-182基因在荣昌猪群体中的遗传平衡状态,并检测了miR-182基因序列突变对其成熟体和靶基因表达量的影响。结果表明:miR-182前体第95位发生了一个G/A突变,该位点在哺乳动物中是高度保守;荣昌猪群体中G、A基因频率分别为0.5945、0.4055,GG、AA、GA,基因型频率分别为0.3535、0.1644、0.4821,且该突变在群体内已处于平衡状态;该突变能影响miR-182的空间结构,导致前体自由能升高9.86%,显著影响其成熟体在皮下脂肪组织中的表达量。

关 键 词:荣昌猪 miR-182 基因多态性 前体突变 表达量 

分 类 号:S828.2[农业科学—畜牧学]

 

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