加利福尼亚兔和新西兰兔UCP1基因第5外显子多态性和生物信息学研究  被引量:1

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作  者:李维[1] 林家栋[1] 刘若余[1] 谢海强[1] 李思[1] 杜雪琴 肖超能[1] 

机构地区:[1]贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖省部共建教育部重点实验室/贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室/贵州大学动物科学学院,贵州贵阳550025 [2]贵阳市小河第三实验学校,贵州贵阳550006

出  处:《江苏农业科学》2016年第1期41-44,共4页Jiangsu Agricultural Sciences

基  金:贵州省科技支撑计划(编号:黔科合NY字[2012]3013号)

摘  要:本试验以加利福尼亚兔和新西兰兔为研究对象,分别用磁珠法动物基因组DNA抽提试剂盒提取新西兰兔和加利福尼亚兔的DNA,通过构建DNA池,扩增UCP1基因的第5外显子及第4内含子部分序列。扩增产物进行双向测序,利用DNAStar和BLAST分析测序结果。结果发现:在加利福尼亚兔中没有发现SNP位点,在新西兰兔中有4个多态性位点,分别为G743T、A744G、C819A和G849T,其中G743T为同义突变,A744G为错义突变,导致编码的苏氨酸(Thr)变为丙氨酸(Ala);C819A、G849T突变位点位于内含子区。多态位点的出现对UCP1基因的RNA二级结构产生的影响表现在其最小自由能由-1.93 MJ/mol变为-1.932 MJ/mol,同时SNPs位点对UCP1基因蛋白结构也有一定影响。

关 键 词:UCP1基因 新西兰兔 加利福尼亚兔 SNPS RNA二级结构 

分 类 号:S829.12[农业科学—畜牧学]

 

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