基于454高通量测序平台血液、呼吸道、消化道临床样本的快速检测  

作　　者：韩娜[1,2] 强裕俊 张婷婷[1,2] 苗娇娇 张雯[1,2] 

机构地区：[1]中国疾病预防控制中心传染病预防控制所生物信息室,北京102206 [2]感染性疾病诊治协同创新中心,浙江杭州310003

出　　处：《中国医药指南》2016年第17期39-41,共3页Guide of China Medicine

基　　金：国家自然科学基金青年基金(课题编号81201322);国家高技术研究发展计划课题(2014AA021505)

摘　　要：目的探讨454高通量测序平台应用于临床样本快速检测的可能性。方法应用454高通量测序平台测定血液、呼吸道和消化道临床样本中微生物菌群的16S r DNA基因的V3-V4高变异区段序列,采用BLAST方法与RDP数据库进行比对,基于比对结果,获得不同种属的病原菌的所匹配的read数。结果 8份临床模拟样本中,7份检测出目标菌属,检出率为87.5%。在血液、肺泡灌洗液和咽拭子这类正常状态下的无菌体液,检测结果较为明确,检出的细菌较为集中,显示了检测结果的可靠性。而对本身含有较多种类细菌的粪便样本,其目标菌比例明显降低。结论实现了80 h内得到血液、呼吸道和消化道临床样本中含有病原菌情况的检测报告,并探讨了高通量测序技术在今后临床实际应用时进一步提高检测速度和灵敏度的方法。

关 键 词：454高通量测序 临床样本 病原菌 检测 

分 类 号：R446[医药卫生—诊断学]