鸭源新城疫病毒SS1株全基因序列测定及遗传进化分析  

作　　者：罗宇宏 陈强[1] 阮涌[1] 主性[1] 段志强[1,2] 胡顺林[3] 刘秀梵[3] 

机构地区：[1]贵州大学动物科学学院,贵州贵阳550025 [2]贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖省部共建教育部重点实验室,贵州贵阳550025 [3]扬州大学农业部畜禽传染病学重点开放实验室,江苏扬州225009

出　　处：《中国家禽》2016年第12期51-55,共5页China Poultry

基　　金：教育部"促进与美大地区科研合作与高层次人才培养项目"(教外司美[2014]2029号);公益性行业(农业)科研专项(201303033);贵州省省校合作计划项目(黔科合LH字[2014]7669号);贵州大学引进人才科研项目(贵大人基合字[2014]10号)

摘　　要：对从贵州省某三穗鸭养殖场病死鸭体内分离的1株新城疫病毒(NDV)Sheldrakeduck/China/Guizhou/SS1/2014(简称SS1株)进行部分生物学特性测定及全基因测序与分析。结果表明:SS1株的MDT、ICPI和IVPI分别为52 h、1.89和2.80,F基因编码蛋白的裂解位点序列为^(112)R-R-Q-K-R-F^(117),HN基因编码571个氨基酸,均符合NDV强毒株特征;SS1株基因组全长为15 192 bp,各基因片段核苷酸序列与代表性基因Ⅶ型毒株ZJ1、NA-1、SF02和FP1/02相似性最高,达96.3%~98.7%,而与疫苗株V4、La Sota和Mukteswar同源性最低,为82.8%~85.4%;根据F基因序列绘制的系统进化树显示SS1株属于ClassⅡ基因Ⅶd亚型。F和HN蛋白氨基酸序列分析发现,SS1株F蛋白中和抗原位点第170位氨基酸、HN蛋白抗原区及其邻近氨基酸位点与国内当前流行的基因Ⅶd亚型NDV毒株一致,而与疫苗株有较大的差异。此外,交叉血凝抑制试验结果表明,SS1株与传统疫苗株La Sota的抗原同源性为84.5%,而与新型基因Ⅶ型疫苗株A-Ⅶ的抗原同源性为100%,表明分离株与疫苗株存在一定的抗原差异。

关 键 词：三穗鸭 新城疫病毒 全基因测序 遗传进化 

分 类 号：S855.3[农业科学—临床兽医学]