依据“ping-pong”循环机制预测piRNA靶基因的搜索方法  被引量:1

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作  者:许甘霖 齐绪峰[2] 蔡冬青[3] 

机构地区:[1]暨南大学再生医学教育部重点实验室,广东广州510632 [2]暨南大学科技部及广东省国际科技合作基地,广东广州510632 [3]暨南大学发育与再生生物学系,广东广州510632

出  处:《基础医学与临床》2017年第3期399-401,共3页Basic and Clinical Medicine

基  金:国家自然科学基金(30973158,81170324,81470433);863计划(2007AA02Z105);科技部港澳台合作专项(2012DFH30060);广东省教育厅国际合作平台项目(2012gjhz0003);广东省自然科学基金重点项目(04105826,S2012020010895);广东省科学与技术发展项目(2004B30601007);广东省科技厅国际合作平台项目(2009B050900007,2013B051000062);广东省科技计划项目(2015B020211010)

摘  要:piRNA是指能与PIWI家族蛋白结合的小RNAs,其功能主要是稳定生殖细胞正常发育,在其他体细胞内也参与生理功能的调控[1]。相当一部分的piRNA通过被称作"pingpong"循环机制去识别与切割其靶基因的转录本mRNA(图1),并通过该机制去实现初级piRNA(primary piRNA)和次级piRNA(secondary piRNA)循环利用,piwil4或piwil2与相应的piRNA结合,通过piRNA的5'端前10~11个碱基作为介导序列,依照碱基互补原则,对与之互补的靶mRNA进行切割,

关 键 词:循环机制 PIRNA ping-pong 碱基互补 转录本 蛋白结合 起始位点 结果符合率 循环利用 大鼠 

分 类 号:Q811.4[生物学—生物工程]

 

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