基于功率谱的流感病毒蛋白质序列结构分析  

Structural Analyses of the Protein Sequences of the Influenza Virus Based on the Power Spectrum

作　　者：梁启浩[1] 李阳[1] 唐旭清[1] 

机构地区：[1]江南大学理学院,无锡214122

出　　处：《病毒学报》2017年第3期313-319,共7页Chinese Journal of Virology

基　　金：国家自然科学基金(项目号:11371174);题目:基于粒计算计算理论的生物网络结构建模;分析与算法研究;江苏省普通高校研究生科研创新计划资助项目(项目号:1145210232141170)~~

摘　　要：基于经典HP模型,本文采用离散傅里叶变换获取蛋白质特征,利用分层聚类方法进行蛋白质序列的结构分析。其目的是将自动信号频谱分析技术与层次聚类方法相结合,并应用到蛋白质序列结构分析中。通过流感病毒HA和NA蛋白质序列的实验结果表明:应用该方法可得到非常好的分类结果。这些研究为基于大数据的蛋白质序列的自动信息提取和结构分析提供基础。Based on the HP model and introduction of discrete Fourier transform spectroscopy to extractpro- tein features, the structural analyses of protein sequences using the hierarchical clustering method is described. We wished to combine automatic signal spectrum analyses with the hierarchical clustering method to analyze protein sequences. Test results on the protein sequences （HA and NA） of the influenza virus demonstrated a new way to obtain good classifications. These results provide a research path for the automatic extraction of information and structural analysis of big data.

关 键 词：流感病毒 离散傅里叶变换 分层聚类 蛋白质序列 

分 类 号：TP391[自动化与计算机技术—计算机应用技术] O29[自动化与计算机技术—计算机科学与技术]