山茴香SRAP反应体系正交设计优化及引物筛选  

Orthogonal Design Optimization and Primer Selection of Carlesia sinensis SRAP System

作　　者：李维卫[1] 王爱兰[2] 聂臻臻 

机构地区：[1]鲁东大学学报编辑部,烟台264025 [2]鲁东大学生命科学学院,烟台264025

出　　处：《基因组学与应用生物学》2017年第8期3103-3109,共7页Genomics and Applied Biology

基　　金：山东省自然科学基金面上项目(ZR2010CM056)资助

摘　　要：为了加强对野生山茴香物种资源的保护,本研究在单因素试验基础上,对山茴香SRAP-PCR反应体系进行了正交设计优化,对主要影响因素:Taq酶、d NTPs、Mg^(2+)、引物进行了4因素3水平的正交设计试验L_9(3~4)。研究表明,最佳反应体系为:Taq聚合酶0.06 U/μL,d NTPs 0.6 mmol/L,Mg^(2+) 1.5 mmol/L,引物0.1μmol/L,总体积25μL。利用最优体系进行了引物筛选,从30对SRAP引物中获得了15对条带清晰,多态性良好的引物组合。本研究为利用SRAP技术进行山茴香种质资源分析、分子遗传育种等研究奠定了技术基础。To strengthen the protection of wild resources of Carlesia sinensis, an orthogonal design was used to optimize a SRAP-PCR system with 4 factors （Taq polymerase, dNTPs, Mg2＋, andprimer） at 3 levels based on the single factor experiment. The optimized system was acquired as following： Taq polymerase 0.06 U/μL, dNTPs 0.6 mmol/L, Mg2＋ 1.5 mmol/L, each primer 0.1 μmol/L, and total volume was 25μL. Primers selection was conducted utilizing the optimized system, 15 primer combinations were selected with abundant polymorphism from 30 primer combinations. The result would provide a technology basis for germ plasm resource analysis and molecular genetic breeding of C. sinensis.

关 键 词：山茴香 SRAP-PCR反应体系 正交设计 引物筛选 

分 类 号：S567.239[农业科学—中草药栽培]