不同哺乳动物GDF9密码子偏性及聚类分析  

作　　者：杨佳栋[1] 刘月琴[1] 张英杰[1] 

机构地区：[1]河北农业大学动物科技学院,河北保定071000

出　　处：《江苏农业科学》2017年第15期41-45,共5页Jiangsu Agricultural Sciences

基　　金：国家现代肉羊产业技术体系项目(编号:CARS-39);河北农业大学青年科学基金(编号:QJ201218)

摘　　要：为更好地认识哺乳动物GDF9基因在长期进化过程中为适应环境形成的密码子使用模式,通过Codon W软件计算不同哺乳动物GDF9基因的密码子偏性指标,利用SPSS软件对密码子偏好性影响因素的相关性进行分析,结合密码子偏性和最小进化法分析其亲缘关系。GCT、TGT、TTT、ATT、CCT、AGA、ACT为哺乳动物GDF9基因的最优密码子,该基因偏爱使用以A或T结尾的密码子;G、C含量和蛋白质亲水性是影响GDF9基因密码子偏性的主要因素;聚类分析提示不同哺乳动物间的同源性越高,GDF9基因密码子使用特征的相似性越高。

关 键 词：哺乳动物 GDF9 碱基替换 密码子偏性 聚类分析 

分 类 号：Q755[生物学—分子生物学]