密码子偏性

作品数：79被引量：550H指数：13
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点地梅属10种植物叶绿体基因组密码子偏好性分析
《中草药》2025年第4期1355-1365,共11页郭玉朋 史明伟 马虎 马彦军 姚步青 
青海民族大学研究生专业示范思政课程建设项目(SK-2022-09)。
目的研究点地梅属Androsace L.物种叶绿体基因组蛋白编码基因密码子的偏好性及其影响因素。方法测序了点地梅属1个物种(西藏点地梅)的叶绿体基因组,其他9物种的序列从NCBI下载。根据序列筛选条件,共得到41条共有序列。用CodonW 1.4.2计...
关键词：点地梅属 密码子偏性 最优密码子 突变压 自然选择 
“红阳”猕猴桃叶绿体基因组密码子使用偏性分析
《西南林业大学学报（自然科学）》2024年第6期81-88,共8页罗秦欢 段炼 赵月梅 
贵州省教育厅自然科学研究项目(黔教技[2022]248号)资助;贵州师范学院博士科研启动项目(2022BS015)资助。
为了解中华猕猴桃优良品种“红阳”猕猴桃的叶绿体基因组密码子的偏好性,利用Codon W和在线CUSP软件对“红阳”猕猴桃叶绿体基因组中的51条编码序列的密码子进行中性绘图、ENC−plot和PR2−plot分析。结果表明:“红阳”猕猴桃密码子不同...
关键词：“红阳”猕猴桃 叶绿体 基因组 密码子偏性 
穿心莲叶绿体基因组密码子偏好性分析
《分子植物育种》2024年第24期8057-8064,共8页吴学俊 汤镕滔 郭松 梁湘兰 范东东 李静宇 王继华 
广东省重点领域研发计划项目(2020B020221001);广西科技师范学院壮瑶药品质生物学校级重点实验室经费(GXKSKYPT2021007);广西科技师范学院2021年大学生创新创业训练计划项目(202111546007)共同资助。
本研究对穿心莲叶绿体基因组密码子使用偏性进行了分析,并探究造成密码子偏好性的主要影响因素。利用软件R Studio、Excel 2019和在线软件CUSP、Codon W 1.4.2等对筛选出的53个蛋白编码区进行计算分析,得到了53个编码蛋白质的基因序列(c...
关键词：穿心莲(Andrographis paniculata) 密码子偏性 叶绿体基因组 最优密码子 
猕猴桃扩展蛋白基因家族鉴定及不同胁迫表达
《分子植物育种》2024年第15期4930-4945,共16页李健 尹鹏 王海荣 安淼 李国田 
山东省重点研发计划项目(2017GNC10118);山东省农业科学院创新工程项目(CXGC2016A03)共同资助。
扩展蛋白是细胞壁的重要组成部分,具有疏松细胞壁、增加细胞壁柔韧性的作用,广泛存在于植物基因组中。本研究以中华猕猴桃(Actinidia chinensis)‘红阳’基因组序列为基础,通过毛果杨扩展蛋白序列进行特征结构域比对从而获得猕猴桃扩展...
关键词：猕猴桃(Actinidia chinensis) 扩展蛋白 基因家族 密码子偏性 基因功能 
玉米AAP基因密码子偏性与进化分析
《天津农学院学报》2024年第3期17-22,共6页王宇 罗希帆 葛均筑 陈帅君 杨红澎 吴疆 
国家自然科学基金(31701378)。
氨基酸透性酶(AAP)通过参与植物体内氨基酸吸收和转运,从而改变植物生长发育。研究其密码子偏好性,对AAP基因异源表达、功能验证及完善其遗传转化体系具有指导意义。使用Codon W、EMBOSS、Origin 2021以及SPSS等程序软件,对25个物种的AA...
关键词：玉米 AAP基因 密码子偏性 聚类分析 异源表达 
辽细辛叶绿体基因组密码子使用偏好性分析被引量：1
《分子植物育种》2024年第9期2864-2872,共9页孙英新 李靖 艾强 吕泽良 刘翠晶 杨利民 
国家重点研发计划项目(2019YFC1710700);财政部、农业农村部:国家现代农业产业技术体系项目(CARS-21);吉林省科技发展计划项目(20210204184YY)共同资助。
确定中草药辽细辛叶绿体基因组密码子使用偏好性及其成因。密码子使用特性利用CodonW 1.4.2软件和CUSP程序分析50条经筛选的CDS序列,结合中性绘图、ENC-plot和PR2-plot分析,最终确定最优密码子。结果显示,叶绿体基因组密码子不同位置碱...
关键词：辽细辛(A.heterotropoides) 叶绿体基因组 密码子偏性 最优密码子 
毛果杨基因家族的密码子特性分析
《分子植物育种》2023年第12期3898-3906,共9页李健 刘家福 徐宏蔚 刘晓 王艳 徐吉臣 
北京林业大学大学生科研训练计划项目资助。
本研究拟探讨杨树基因家族的密码子特征,为深入解析杨树基因家族的进化规律并为分子育种奠定基础。本研究基于测序的毛果杨基因组,鉴定扩展蛋白(Expansin)、肌动蛋白(Actin)、纤维素合酶(Cellulose synthase,Ces)、果胶甲酯酶(pectin me...
关键词：毛果杨 基因家族 密码子偏性 基因表达 
艾纳香叶绿体基因组密码子使用偏性分析被引量：2
《西部林业科学》2023年第3期55-62,77,共9页赵月梅 徐其碧 杨贵清 尹鑫 徐林 
国家自然科学基金项目(31900273);贵州师范学院博士科研启动项目(2022BS015);大学生创新创业训练计划项目(S202114223051)。
为了明确艾纳香叶绿体基因组密码子的使用偏性,以53条蛋白质编码序列为研究对象,利用Codon W 1.4.2和在线软件CUSP等对其密码子进行中性绘图、ENC-plot和PR2-plot分析。结果显示:(1)艾纳香叶绿体基因组密码子不同位置GC碱基含量为GC 1(4...
关键词：艾纳香 叶绿体基因组 最优密码子 密码子偏性 
‘玉铃铛’枣叶绿体基因组特征及密码子偏性被引量：2
《分子植物育种》2023年第8期2488-2498,共11页郭晓雨 张晓慧 马宗新 李文峰 李慧慧 
安徽省林业科技创新研究计划项目(AHLYCX-2021-21)资助。
为探究‘玉铃铛’枣叶绿体基因组密码子的使用模式,本研究利用Illumina NovaSeq平台进行测序并组装,获得其叶绿体全基因组序列;利用CodonW 1.4.2、CUSP、SPSS、MISA v1.0等软件分析其密码子偏好性。结果表明,‘玉铃铛’枣叶绿体基因组...
关键词：‘玉铃铛’枣 叶绿体基因组 密码子偏好性 最优密码子 
樟叶槭叶绿体基因组序列密码子偏性分析被引量：8
《西北林学院学报》2023年第1期102-107,共6页段祥光 于涛 曹萌 马文宝 
极小种群野生动植物资源拯救项目;四川省科技支撑项目(2020YJ470)。
为确定槭属樟叶槭叶绿体基因组密码子使用模式和原因,通过对樟叶槭叶绿体基因组中筛选的53条基因序列进行中性绘图、ENC-plot与PR2-plot等分析,确定樟叶槭叶绿体基因组密码子偏好性基本特征与其最佳密码子的构成,分析过程中主要使用Codo...
关键词：樟叶槭 叶绿体基因组 密码子 偏好性 最优密码子 
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