来源于西洋梨的苹果茎沟病毒分离物基因组分子特性研究  

作　　者：张雪娇[1] 王利平[2] 赵振军[1] 郑银英[1] 陈婕[2] 崔百明[1] 

机构地区：[1]石河子大学,新疆石河子832003 [2]华中农业大学湖北省作物病害监测与安全控制重点实验室,湖北武汉430070

出　　处：《江苏农业科学》2017年第18期43-47,共5页Jiangsu Agricultural Sciences

基　　金：国家自然科学基金(编号:31201488);国家梨产业技术体系(编号:nycytx-29-08)

摘　　要：为了获得来源于西洋梨红贝雷沙寄主潜带苹果茎沟病毒(ASGV)分离物的基因组全长序列,并明确其分子特性,采用RT-PCR、RACE末端克隆及生物信息学方法,对ASGV分离物基因组全长进行序列测定,并对其序列特点进行分析。结果发现,来源于西洋梨的ASGV-HB分离物的基因组全长序列为6 496 nt(Gen Bank登录号:KU605672),含有2个开放阅读框ORF1、ORF2及2个可变区Ⅵ、Ⅶ。序列分析表明ASGV-HB与Gen Bank登录的18个ASGV分离物的基因组全长核苷酸序列同源性为80.6%~87.7%;ORF1和ORF2编码的氨基酸同源性分别为84.3%~92.3%和94.4%~98.7%;Ⅵ和Ⅶ可变区的氨基酸序列同源性分别为22.9%~68.8%和48.8%~92.2%;系统发育树分析显示,来源于不同国家的相同寄主的ASGV分离物聚集为同一分支。结果表明,ASGV的分子变异无地域相关性,具有一定的寄主选择性,研究结果为进一步探究ASGV的群体遗传进化机制及其防治提供了重要的分子信息。

关 键 词：梨 苹果茎沟病毒 基因组全长序列 系统发育树分析 同源性 

分 类 号：S436.611.19[农业科学—农业昆虫与害虫防治]