牛乳头瘤病毒基因1型贵州GZLZ流行株全基因组序列测定及分析  

Sequence analysis of the complete genome of bovine papillomavirus type 1 genotype GZLZ strain from skin samples of cows in GuiZhou,China

作　　者：张海[1] 张军 杨忠成 廖梅 周碧君[1] 王开功[1] 文明[1] 程振涛 王伟[1] 胡兴义 

机构地区：[1]贵州大学动物科学学院,贵州贵阳550025 [2]贵州省六盘水市动物卫生监督所,贵州六盘水553001 [3]贵州省畜禽遗传资源管理站,贵州贵阳550001

出　　处：《中国预防兽医学报》2017年第9期755-757,共3页Chinese Journal of Preventive Veterinary Medicine

基　　金：贵州省黔南州社会发展科技重大计划项目<喀斯特石漠化林草牧综合治理技术研究与示范>[黔南社发科(20140325)];贵州现代肉牛产业技术体系专项(GZCYTX2015-0302-02);贵州省农业委员会科技专项<动物疫病防控能力提升专项>(黔农财[2015]149号);贵州省农业委员会科技计划项[2016-01号];"贵州省动物疫病防控与兽医公共卫生保障科技创新人才团队"(黔科合人才团队[2015]4016号)

摘　　要：为了解牛乳头瘤病毒(BPV)GZLZ流行株全基因组序列、结构特征及遗传变异情况,本研究首先提取贵州六枝患病牛皮肤肿瘤样品DNA,以BPV L1基因的简并引物对其进行PCR扩增,测序并构建BPVL1基因进化树确定其为BPV1基因型。根据GenBank中BPV1参考株设计7对特异性引物,经扩增、测序、拼接后获得BPV流行株全基因组序列。序列分析显示,贵州六枝GZLZ流行株基因组全长为7 946 bp,具有BPV1基因型的结构特征。本研究为贵州地区的牛乳头状瘤的病原鉴定、流行规律以及科学的防控提供依据。To study the complete genome sequence, structure characteristics, and genetic variation of the bovine papillomavirus （BPV） GZLZ epidemic strain originated, from the skin samples of caries in Liuzhi, Guizhou, genotyping of GZLZ strain was first determined by PCR based on L1 gene. The whole genome sequence of BPV GZLZ strain was obtained by PCR with 7 pairs of primers designed according to the BPV1 reference strains in GenBank. The sequence analyses showed that the full-length of the GZLZ s train was 7 946 bp, and belonged to BPV1 genotype. This study provided the basis for the identification of pathogen, epidemiology, scientific prevention and control of bovine papilloma in Guizhou.

关 键 词：牛乳头瘤病毒基因1型 全基因组序列 序列分析 

分 类 号：S852.65[农业科学—基础兽医学]