全基因组序列

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番茄褐色皱纹果病毒(ToBRFV)云南建水分离物鉴定及全基因组序列分析
《植物病理学报》2025年第2期194-202,共9页肖雨晴 吕高莹 李树军 陈永对 苏晓霞 杨李源滨 周晓罡 余大朝 王田田 郑宽瑜 张仲凯 
云南省科技计划重大科技专项(202202AE090022);神谷科技张仲凯专家工作站;云南种子种业联合实验室(202205AR070001);云南省中青年学术和技术带头人后备人才项目(202305AC160026)。
番茄褐色皱纹果病毒(tomato brown rugose fruit virus,ToBRFV)近年来在全球番茄产区快速发生蔓延,造成严重的经济损失。云南建水番茄上出现疑似ToBRFV感染的症状,并对周边番茄产区产生危害。本研究对云南建水田间疑似ToBRFV感染的番茄...
关键词：番茄褐色皱纹果病毒 云南建水 番茄果实 病毒基因组 系统进化分析 
水獭源犬圆环病毒的全基因组序列分析
《畜牧兽医学报》2025年第4期1989-1994,共6页匡尹之 徐凤培 周沛 
广州市科技局基础与应用基础专题(SL2022A04J00674);广东省自然科学基金(2023A1515012171)。
犬圆环病毒(canine circovirus, CanineCV)是一种与犬消化道疾病相关的病毒,该病毒于2012年在美国首次从犬中鉴定。随后,研究人员相继在狼、獾、北极狐、赤狐、豺中检测到了CanineCV。2016年,我国首次报道从犬中检测到CanineCV,然而,关...
关键词：犬圆环病毒 水獭 流行病学 遗传进化分析 
林麝源酪黄肠球菌的分离鉴定及全基因组序列分析
《微生物学通报》2025年第3期1265-1280,共16页杨凯惟 丁慧 马炳存 李增婷 伍茜 刘洁 罗燕 
四川省自然科学基金(2024NSFSC0378)。
【背景】酪黄肠球菌(Enterococcus casseliflavus)为肠球菌属(Enterococcus)中的一种机会性致病菌,其广泛存在于自然界中,但是目前林麝源酪黄肠球菌的相关研究甚少。【目的】对从病死林麝肝脏中分离出的一株酪黄肠球菌进行分离鉴定和全...
关键词：林麝 酪黄肠球菌 耐药性 全基因组序列分析 
云南省2023年活禽市场8株H9N2亚型禽流感病毒全基因组序列分析
《中国热带医学》2025年第3期350-357,共8页刘照生 伏晓庆 罗春蕊 赵晓南 张美玲 孙艳红 陈瑶瑶 韩晓宇 倪瑞泽 毛泽波 周洁楠 
目的 深入研究2023年云南地区活禽市场中H9N2亚型禽流感病毒的分子生物学特性和演化趋势,为制定云南地区H9N2亚型禽流感的防控策略提供科学依据。方法 采集2023年云南省活禽市场的环境标本进行H9N2亚型核酸检测,对阳性标本进行鸡胚病毒...
关键词：禽流感 基因组 高/低致病性 云南省 
1株鸽新城疫病毒分离鉴定与全基因组序列分析
《中国动物传染病学报》2025年第1期181-187,共7页尹德玮 赵钟毅 吕荞 闭璟珊 汪伟 郑敏 罗廷荣 李晓宁 
国家自然科学基金(31560707);广西壮族自治区林业基金(GX202102)。
本研究对2020年从广西地区采集的疑似鸽新城疫临床样品,进行了病毒分离、致病力鉴定,并进行全基因组测序和遗传进化分析。结果成功分离到1株鸽新城疫病毒,致病力试验证实为高毒力毒株;该毒株F蛋白裂解位点序列为112RRQKRF117。通过绘制...
关键词：鸽新城疫 分离 鉴定 F基因 HN基因 遗传进化分析 
2018-2024年上海市人腺病毒B亚属全基因组序列特征分析
《病毒学报》2025年第1期135-140,共6页刘嘉婧 张万菊 崔晓青 张靖翊 房方皓 陈敏 滕峥 
上海市加强公共卫生体系建设三年行动计划(2023-2025年)优秀青年人才项目(项目号:GWVI-11.2-YQ42),题目:人腺病毒遗传多态性及感染力变化研究;上海市加强公共卫生体系建设三年行动计划(2023-2025年)(项目号:GWVI-3)题目:超大城市生物安全关键能力和公共卫生实验室网络一体化建设。
为了解上海市人腺病毒B亚属(Human adenovirus species B,HAdV-B)基因序列及遗传进化特征,为人腺病毒(Human adenovirus,HAdV)相关疾病防控及疫苗研发提供科学依据,本研究选取了13例2018-2024年上海市HAdV-B感染病例样本进行全基因组序...
关键词：人腺病毒B亚属 上海 全基因组序列 分子特征 
2022年山东省鼠类汉坦病毒携带情况调查及其全基因组序列分析
《中华实验和临床病毒学杂志》2025年第1期56-61,共6页刘昱薇 姚明晓 张金艳 段青 逄博 翟文济 李仁鹏 寇增强 
山东省医药卫生科技发展计划(202112050731);山东省疾病预防控制中心青年创新基金项目(QC-202302)。
目的分析2022年山东省淄博市鼠类携带汉坦病毒情况及病毒的遗传进化特征,为肾综合征出血热的科学防控提供参考依据。方法采用实时荧光定量RT-PCR检测试剂盒(Real-Time PCR Method)检测鼠肺中汉坦病毒核酸并鉴定汉坦病毒种类。设计引物,...
关键词：汉坦病毒 鼠类 全基因组 
水蜡A病毒丁香分离物的鉴定与全基因组序列分析
《中国农学通报》2025年第3期107-113,共7页王昀轩 刘丽 孙春辉 鲁书豪 梁宇卿 崔雯莉 高佳仪 李永强 
北京市教委科研项目“利用siRNA序列组装技术鉴定葡萄新病毒”(KM201610020008)。
研究旨在明确侵染北京丁香(Syringa lindl)并引起褪绿、花叶、卷叶症状的病毒种类,以及其基因组分子特征和进化关系。利用小RNA深度测序和RT-PCR技术对病样进行检测分析。深度测序结果显示病样中检测到水蜡A病毒(ligustrum virus A,LVA...
关键词：丁香 水蜡A病毒 小RNA 基因组 序列分析 分子特征 进化关系 
山西地区鸽圆环病毒全基因组序列的测定与分析
《中国预防兽医学报》2025年第1期96-101,共6页张娟 任鹏飞 李兴 高振 王仲兵 梁立滨 
山西省基础研究计划面上项目(202103021224156);山西农业大学博士科研启动项目(2021BQ78)。
为了解山西地区鸽圆环病毒(PiCV)的遗传演化特征,本研究从山西太原、晋中等地区鸽养殖场采集10份疑似感染PiCV的病料样品经常规处理后进行Cap基因的PCR检测。结果显示,从10份病料样品中检测到1份PiCV阳性样品,将鉴定的PiCV命名为SX01/Sh...
关键词：鸽圆环病毒 全基因组 遗传进化分析 重组分析 
云南省某鹅场鹅细小病毒检测与全基因组序列分析
《中国动物检疫》2025年第1期111-115,共5页董路 杜润 何依蓉 相德才 赵珍 曾邦权 杨丽珠 林尊诚 段博芳 
2023年12月,云南省腾冲市某地鹅场雏鹅突然发病死亡,怀疑为鹅细小病毒(GPV)感染。为确定致病原,通过荧光定量PCR对临床病料样品进行了GPV核酸检测,并通过宏基因组测序对阳性样品全基因组进行了序列分析。结果显示;临床样品中检出GPV阳...
关键词：鹅细小病毒 小鹅瘟 全基因组 荧光定量PCR 序列分析 
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