全基因组序列分析

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相关机构：中国农业科学院哈尔滨兽医研究所山东农业大学华南农业大学中国疾病预防控制中心更多>>
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番茄褐色皱纹果病毒(ToBRFV)云南建水分离物鉴定及全基因组序列分析
《植物病理学报》2025年第2期194-202,共9页肖雨晴 吕高莹 李树军 陈永对 苏晓霞 杨李源滨 周晓罡 余大朝 王田田 郑宽瑜 张仲凯 
云南省科技计划重大科技专项(202202AE090022);神谷科技张仲凯专家工作站;云南种子种业联合实验室(202205AR070001);云南省中青年学术和技术带头人后备人才项目(202305AC160026)。
番茄褐色皱纹果病毒(tomato brown rugose fruit virus,ToBRFV)近年来在全球番茄产区快速发生蔓延,造成严重的经济损失。云南建水番茄上出现疑似ToBRFV感染的症状,并对周边番茄产区产生危害。本研究对云南建水田间疑似ToBRFV感染的番茄...
关键词：番茄褐色皱纹果病毒 云南建水 番茄果实 病毒基因组 系统进化分析 
水獭源犬圆环病毒的全基因组序列分析
《畜牧兽医学报》2025年第4期1989-1994,共6页匡尹之 徐凤培 周沛 
广州市科技局基础与应用基础专题(SL2022A04J00674);广东省自然科学基金(2023A1515012171)。
犬圆环病毒(canine circovirus, CanineCV)是一种与犬消化道疾病相关的病毒,该病毒于2012年在美国首次从犬中鉴定。随后,研究人员相继在狼、獾、北极狐、赤狐、豺中检测到了CanineCV。2016年,我国首次报道从犬中检测到CanineCV,然而,关...
关键词：犬圆环病毒 水獭 流行病学 遗传进化分析 
林麝源酪黄肠球菌的分离鉴定及全基因组序列分析
《微生物学通报》2025年第3期1265-1280,共16页杨凯惟 丁慧 马炳存 李增婷 伍茜 刘洁 罗燕 
四川省自然科学基金(2024NSFSC0378)。
【背景】酪黄肠球菌(Enterococcus casseliflavus)为肠球菌属(Enterococcus)中的一种机会性致病菌,其广泛存在于自然界中,但是目前林麝源酪黄肠球菌的相关研究甚少。【目的】对从病死林麝肝脏中分离出的一株酪黄肠球菌进行分离鉴定和全...
关键词：林麝 酪黄肠球菌 耐药性 全基因组序列分析 
云南省2023年活禽市场8株H9N2亚型禽流感病毒全基因组序列分析
《中国热带医学》2025年第3期350-357,共8页刘照生 伏晓庆 罗春蕊 赵晓南 张美玲 孙艳红 陈瑶瑶 韩晓宇 倪瑞泽 毛泽波 周洁楠 
目的 深入研究2023年云南地区活禽市场中H9N2亚型禽流感病毒的分子生物学特性和演化趋势,为制定云南地区H9N2亚型禽流感的防控策略提供科学依据。方法 采集2023年云南省活禽市场的环境标本进行H9N2亚型核酸检测,对阳性标本进行鸡胚病毒...
关键词：禽流感 基因组 高/低致病性 云南省 
1株鸽新城疫病毒分离鉴定与全基因组序列分析
《中国动物传染病学报》2025年第1期181-187,共7页尹德玮 赵钟毅 吕荞 闭璟珊 汪伟 郑敏 罗廷荣 李晓宁 
国家自然科学基金(31560707);广西壮族自治区林业基金(GX202102)。
本研究对2020年从广西地区采集的疑似鸽新城疫临床样品,进行了病毒分离、致病力鉴定,并进行全基因组测序和遗传进化分析。结果成功分离到1株鸽新城疫病毒,致病力试验证实为高毒力毒株;该毒株F蛋白裂解位点序列为112RRQKRF117。通过绘制...
关键词：鸽新城疫 分离 鉴定 F基因 HN基因 遗传进化分析 
2022年山东省鼠类汉坦病毒携带情况调查及其全基因组序列分析
《中华实验和临床病毒学杂志》2025年第1期56-61,共6页刘昱薇 姚明晓 张金艳 段青 逄博 翟文济 李仁鹏 寇增强 
山东省医药卫生科技发展计划(202112050731);山东省疾病预防控制中心青年创新基金项目(QC-202302)。
目的分析2022年山东省淄博市鼠类携带汉坦病毒情况及病毒的遗传进化特征,为肾综合征出血热的科学防控提供参考依据。方法采用实时荧光定量RT-PCR检测试剂盒(Real-Time PCR Method)检测鼠肺中汉坦病毒核酸并鉴定汉坦病毒种类。设计引物,...
关键词：汉坦病毒 鼠类 全基因组 
水蜡A病毒丁香分离物的鉴定与全基因组序列分析
《中国农学通报》2025年第3期107-113,共7页王昀轩 刘丽 孙春辉 鲁书豪 梁宇卿 崔雯莉 高佳仪 李永强 
北京市教委科研项目“利用siRNA序列组装技术鉴定葡萄新病毒”(KM201610020008)。
研究旨在明确侵染北京丁香(Syringa lindl)并引起褪绿、花叶、卷叶症状的病毒种类,以及其基因组分子特征和进化关系。利用小RNA深度测序和RT-PCR技术对病样进行检测分析。深度测序结果显示病样中检测到水蜡A病毒(ligustrum virus A,LVA...
关键词：丁香 水蜡A病毒 小RNA 基因组 序列分析 分子特征 进化关系 
云南省某鹅场鹅细小病毒检测与全基因组序列分析
《中国动物检疫》2025年第1期111-115,共5页董路 杜润 何依蓉 相德才 赵珍 曾邦权 杨丽珠 林尊诚 段博芳 
2023年12月,云南省腾冲市某地鹅场雏鹅突然发病死亡,怀疑为鹅细小病毒(GPV)感染。为确定致病原,通过荧光定量PCR对临床病料样品进行了GPV核酸检测,并通过宏基因组测序对阳性样品全基因组进行了序列分析。结果显示;临床样品中检出GPV阳...
关键词：鹅细小病毒 小鹅瘟 全基因组 荧光定量PCR 序列分析 
长沙市动物源大肠杆菌耐药性分析及分子分型研究
《现代畜牧兽医》2025年第1期66-70,共5页周汝顺 杨嘉豪 江燕 陈启友 刘曙光 张建超 隆雪明 
湖南省教育厅资助科研项目(22B0189)。
试验旨在了解湖南长沙地区动物源性细菌对常见抗菌药物的耐药情况,对2023年从长沙市周边分离的动物源大肠杆菌耐药情况及耐药基因、毒力基因和亲缘关系进行了研究。结果显示:从36个养殖场采集到407份生物样品并分离到大肠杆菌332株,分...
关键词：动物源大肠杆菌 耐药性 多重耐药 全基因组序列分析 系统发育树 
中国沿海地区乙型脑炎患者感染基因型的血清学调查
《中华实验和临床病毒学杂志》2024年第6期641-641,共1页邹文菁(编译) 
乙型脑炎病毒(Japanese encephalitis virus,JEV)主要通过蚊媒传播,是亚太地区引起病毒性脑炎的主要病原体。根据E基因和全基因组序列分析,JEV可分为五种基因型(G1-G5)。通过对2018年至2020年中国山东、浙江和广东三个沿海省份乙型脑炎...
关键词：血清学调查 乙型脑炎病毒 血清学方法 病毒性脑炎 JEV 沿海省份 全基因组序列分析 中国沿海地区 
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