系统进化分析

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向日葵热激转录因子基因家族鉴定及其在非生物胁迫下的表达分析
《浙江大学学报(农业与生命科学版)》2025年第2期303-317,共15页宋慧芳 薛宏宇 王茜 卢俊洁 李晨雨 刘阿克 
山西省基础研究计划(自由探索类)面上项目(202303021211192);山西省高等学校科技创新计划项目(2021L514);山西省“1331工程”优势特色学科建设计划项目(1331KSC)。
热激转录因子(heat shock transcription factor, HSF)广泛分布于植物中,参与多种转录调控途径,特别是热应激信号传导和其他应激反应。本研究利用生物信息学方法研究HSF基因家族,对其系统发育关系、基因结构和表达模式等进行了分析。结...
关键词：向日葵 HSF基因家族 系统进化分析 基因重复 基因表达 
番茄褐色皱纹果病毒(ToBRFV)云南建水分离物鉴定及全基因组序列分析
《植物病理学报》2025年第2期194-202,共9页肖雨晴 吕高莹 李树军 陈永对 苏晓霞 杨李源滨 周晓罡 余大朝 王田田 郑宽瑜 张仲凯 
云南省科技计划重大科技专项(202202AE090022);神谷科技张仲凯专家工作站;云南种子种业联合实验室(202205AR070001);云南省中青年学术和技术带头人后备人才项目(202305AC160026)。
番茄褐色皱纹果病毒(tomato brown rugose fruit virus,ToBRFV)近年来在全球番茄产区快速发生蔓延,造成严重的经济损失。云南建水番茄上出现疑似ToBRFV感染的症状,并对周边番茄产区产生危害。本研究对云南建水田间疑似ToBRFV感染的番茄...
关键词：番茄褐色皱纹果病毒 云南建水 番茄果实 病毒基因组 系统进化分析 
中蒙边境野狼中一株犬细小病毒的鉴定与遗传进化分析
《中国口岸科学技术》2025年第4期62-68,共7页吴后艳 彭勇 王振宝 陶剑 艾军 
野生动物重要病原跨境传播风险分析;监测预警及示范作用(2022YFC2601605)。
为探究中国与蒙古国边境地区犬细小病毒(Canine Parvovirus,CPV)流行株和病毒株遗传变异进化情况,从中蒙边境地区收集到14份狼组织样品,经处理后初步利用荧光PCR检测,将检测结果为阳性的样品针对CPV的VP2基因片段进行聚合酶链式反应(Pol...
关键词：犬细小病毒 分离鉴定 系统进化分析 
药用植物两面针叶绿体基因组特征及系统进化分析
《林业与生态科学》2025年第1期83-92,共10页刘涵 孙冲 肖佳林 黄勤琴 刘华敏 黄威 黄姗 刘霞 
国家自然科学基金项目(31901324);重庆市教委青年项目(KJQN202201337,KJQN202201332,KJQN202101320,KJQN201801344);重庆市博士后特别资助项目(2021XM2010)。
为明确两面针叶绿体基因组的结构组成及其系统进化关系,研究花椒属物种遗传多样性、分子育种及野生种质资源开发利用,以两面针叶片为材料,利用改良CTAB法提取两面针叶片总DNA,基于BGISeq-500平台进行高通量测序,采用SPAdes v3.13.0软件...
关键词：叶绿体基因组 系统进化 种质资源 分子标记 两面针 
基于DNA条形码序列的天目竹节人参及其近缘种系统进化分析
《浙江农业科学》2025年第3期623-626,共4页肖文斐 严建立 忻雅 柴伟国 
浙江省公益性技术应用研究项目(LGN21C020003)。
为探讨天目竹节人参的进化地位,以天目竹节人参为试材,利用PCR法扩增ITS1/ITS2、ITS2、psbA-trnH、rbcL等4种DNA条形码标记片段序列,同时从NCBI下载8种人参属植物及3种外属植物的同源序列,利用MEGA 11.0软件构建系统发育树,从分子水平...
关键词：天目竹节人参 人参属 DNA条形码 系统进化 
我国部分地区牛冠状病毒S基因遗传变异分析
《中国动物传染病学报》2025年第1期188-198,共11页张欣怡 高辉 崔进 房琳琳 郑辉 刘爽 魏荣 李晓成 肖啸 董雅琴 
农业农村部动物冠状病毒监测预警项目(16220223)。
为了解我国部分地区牛冠状病毒(BCoV)流行及变异情况,2020—2021年,收集我国9个省份53个临床发病牛群的拭子、粪便、组织等样品1432份,采用实时荧光RT-PCR方法进行BCoV检测,并选取部分核酸阳性样品进行S基因全长的扩增、测序与遗传变异...
关键词：牛冠状病毒 S基因 系统进化分析 氨基酸变异 
2022年山东省济南市某医院DBV的全基因组测序和遗传进化研究
《病毒学报》2025年第1期141-147,共7页申园园 韦雪敏 张宇涵 张新宇 李超 宋丽 赛林涛 许一菲 
国家重点研发计划重点专项(项目号:2023YFC2308502),题目:老年人群新发传染病高易感性和重症化机制研究;江苏省自然科学青年基金(项目号:BK20220270),题目:新布尼亚病毒SFTSV的实时精准检测与溯源研究。
本研究旨在探究2022年山东省济南市某医院大别班达病毒(Dabie bandavirus,DBV)的基因组特征和遗传变异规律。在山东省某医院采集6例疑似发热伴血小板减少综合征(Severe fever with thrombocytopenia syndrome,SFTS)患者的血样,提取DBV ...
关键词：大别班达病毒 全基因组 遗传进化 系统进化分析 
上海市浦东新区市售食品中创伤弧菌病原学遗传特征
《中国热带医学》2025年第1期87-94,共8页梁艳茹 吕彬 胡旖桓 丁锦 桂燕华 邱慧芳 丰俊 赵冰 王筱 
上海市加强公共卫生体系建设三年行动计划(2023-2025年)重点学科(GWVI-11.1-02-传染病学);上海市浦东新区疾病预防控制中心科研项目(No.PDCDC-2023-09)。
目的了解上海市浦东新区市售食品中创伤弧菌污染情况、耐药基因和毒力基因携带情况、基因分型特征与遗传进化关系。方法采用微量肉汤法进行药物敏感性实验,使用illumina测序平台进行全基因组测序,基于毒力基因数据库、耐药基因数据库、P...
关键词：创伤弧菌 耐药 毒力基因 耐药基因 系统进化分析 市售食品 
广州市2023年13株登革病毒2型全基因组序列特征分析
《中国热带医学》2025年第1期110-116,共7页马晋哲 梁玉凤 周志坚 冯晓雯 李芬香 陈绮 严华成 万成松 
目的分析2023年广州市登革病毒2型(dengue serotype 2 virus,DENV-2)分离株的全基因组序列特征,为本地登革热防控提供新的基础数据。方法使用C6/36细胞分离登革热患者血清中的登革病毒,使用纳米孔测序技术(Nanopore平台)对登革病毒进行...
关键词：登革热 登革病毒2型 全基因组测序 纳米孔测序技术 系统进化分析 广州 
一起CV-A5引起的疱疹性咽峡炎疫情分子流行病学分析
《热带医学杂志》2025年第1期110-112,123,共4页曾庆 张晓 杨结仪 刘静雯 耿进妹 李魁彪 狄飚 谢华萍 
广州市医学重点学科(2025-2027-11);广州市卫生健康科技项目(20221A010041,20221A011071)。
目的对2022年5月广州市某幼儿园一起疱疹性咽峡炎(HA)疫情进行病原学鉴定及病原基因特征分析。方法采用统一调查表对某幼儿园于2022年5月23-31日诊断为疱疹性咽峡炎及同一幼儿园有发热,伴咽痛、口腔疱疹等症状之一患儿进行个案调查。采...
关键词：疱疹性咽峡炎 柯萨奇病毒A5 VP1基因 系统进化分析 
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