澳洲坚果SSR-PCR反应体系优化及其应用  

Optimization and Application of SSR-PCR Reaction System for Macadamia

作　　者：唐莹莹[1] 杨祥燕[1] 蔡元保[1] 李穆[1] 曾黎明[1] 郑文武 邱文武[2] 李季东 叶维雁 TANG Ying-ying;YANG Xiang-yan;CAI Yuan-bao;LI Mu;ZENG Li-ming;ZHENG Wen-wu;QIU Wen-wu;LI Ji-dong;YE Wei-yan(Guangxi Subtropical Crops Research Institute,Nanning,Guangxi 530001,China;Horticultural Research Institute,Guangxi Academy of Agricultural Sciences,Nanning,Guangxi 530007,China)

机构地区：[1]广西壮族自治区亚热带作物研究所,广西南宁530001 [2]广西壮族自治区农业科学院园艺研究所,广西南宁530007

出　　处：《福建农业学报》2018年第2期154-158,共5页Fujian Journal of Agricultural Sciences

基　　金：广西自然科学基金项目(2016GXNSFBA380005);广西创新驱动发展专项(桂科AA17204058-4;桂科AA17204058-8);广西直属公益性科研院所基本科研业务费专项(桂热研201803;桂热研201710);广西农业科学院科技发展基金资助项目(桂农科2017JM15);南宁市科学研究与技术开发计划项目(20172154-1)

摘　　要：以澳洲坚果DNA为模板,通过单因素设计方法对影响SSR-PCR反应体系的5个主要因素进行了优化。结果表明,澳洲坚果SSR-PCR反应体系的最适条件为:20μL的反应体系中,包含30mg·L^(-1)模板DNA,1.0UTaq聚合酶,2.5mmol·L^(-1) Mg^(2+),0.6μmol·L^(-1)引物和0.3mmol·L^(-1)dNTPs。采用该反应体系对不同引物和15份澳洲坚果种质进行验证,扩增条带的可靠性和稳定性良好,且分辨率较高。因此,该SSR-PCR反应体系可用于澳洲坚果种质源鉴定及遗传多样性分析研究。Five major factors of the SSR-PCR reaction system were optimized for genomic DNA of macadamia(Macadamia spp.)by a single factor design.The volume of optimum reaction system was 20μL that consisted of 30 mg·L-1 template DNA,1.0 U Taq polymerase,2.5 mmol·L-1 Mg 2+,0.6μmol·L-1 primer and 0.3 mmol·L-1 dNTPs.On 15 germplasms of macadamia using different SSR primers,the system proved to be reliable and stable in the amplification bands with high resolution.Consequently,it seemed adequate for the identification and genetic diversity analysis of macadamia germplasms.

关 键 词：澳洲坚果 SSR-PCR 体系优化 单因素设计 

分 类 号：S184[农业科学—农业基础科学]